维甲酸结合蛋白的分子可及性与该蛋白和配体相互作用的关系的研究

摘要

从蛋白质可及性分析了角度研究了ＥＲＡＢＰ与ＲＡ的相互作用模式，原子水平和残基水平上计算了四个与维甲酸结合蛋白（ＥＲＡＢＰ）有关的分子的可及性，这个四分子是ＥＰＡ（无配体结晶生成的ＥＲＡＢＰ），ＥＰＢ－ＲＡ（ＥＲＡＢＰ和配体维甲酸ＲＡ，并对其进行了分析比较，分析结果表明，ＲＡ在结合蛋白中采取β－芷香酮环向里，羧基端向外的构象形式；围绕结合部位有２４个残基；在结合配体ＲＡ时，在结合配体ＲＡ时，结合蛋白