鹅副粘病毒SF02 F基因的序列分析及SF02的多重RT-PCR鉴别

摘要

对新近分离的鹅副粘病毒SF02采用RT-PCR方法, 扩增F基因后测序, 得到全长的F基因. 该基因的ORF总长为1 662 nt, 编码553个氨基酸, 其裂解位点的序列为112R-R-Q-K-R-F117, 与新城疫病毒强毒株的特征相符. 其核苷酸和氨基酸同源性分析, 并与国内新城疫病毒标准强毒株F48E9相比较, 表明该毒株在F基因上已发生了较大的变异, 而与近年来在我国台湾和部分西欧国家流行的禽副粘病毒有很高的亲缘关系. 在分析F基因序列的基础上, 设计3条引物, 建立了一种新的多重RT-PCR方法, 能区分鸡新城疫病毒与鹅副粘病毒.