尼罗罗非鱼Sox基因PCR-SSCP分析

摘要

参照人SRY基因HMG-box保守区序列,设计1对兼并引物,采用PCR技术扩增了尼罗罗非鱼Sox基因,在雌、雄尼罗罗非鱼个体中均扩增出5条带,大小分别约为200、400、600、800、1200 bp,回收200 bp左右扩增产物进行克隆,阳性克隆采用SSCP分析,筛选不同基因片段.进一步对筛选的不同基因进行测序,结果获得了5个不同的228 bp Sox基因.与Gen-Bank联机,采用BLAST方法与人类相应SOX基因进行序列比对,发现其与人类相应SOX蛋白的氨基酸序列一致性分别为97.2%、97.2%、94.4%、96%、88.2%,显示出这些基因在分子进化上具有高度的保守性.