猪繁殖与呼吸综合征病毒BJ株、GD株全基因组序列测定与分析

摘要

利用RT-PCR方法分别扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)北京分离株(BJ株)、广东分离株(GD株)各9条基因片段,并将这9个片段分别克隆于PGEM-T-easy质粒载体上进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到PRRSV BJ株和GD株的全基因组cDNA (GenBank: EU825723, EU825724).测序结果表明,BJ株和GD株基因组全长分别为15 340和15 336 bp,各包含9个开放式阅读框,5′ UTR都含有189nt,3′端URT分别含有170 nt、166 nt,其中各包含20 nt Poly(A)、16 nt Poly(A).基因组序列分析结果显示,BJ株和GD株与ATCC VR-2332的核苷酸同源性分别为88.9%和89.0%,与高致病性PRRSV毒株JXA1的核苷酸同源性分别为99.0%和99.4%,与PRRSV毒株HuN的核苷酸同源性分别为98.8%和98.9%.