室间隔缺损相关的长链非编码RNA TUC40-的生物信息学及表达谱分析

摘要

目的 探讨TUC40-在人和小鼠心脏胚胎发育过程中是否发挥作用.方法 应用生物信息学网站NCBI、UCSC、Uniprot及软件Clustal、DNAMAN、MEGA 6等,对TUC40-及其编码片段uc.40-进行分析;采用链特异性逆转录实时定量聚合酶链反应检测TUC40-与其正义链产物Pbx1 mRNA在小鼠胚胎心脏发育关键时间点的表达谱.结果 Uc.40-于核苷酸序列、基因组位置及转录因子结合位点3个水平在人和小鼠具有保守性.TUC40-与Pbx1 mRNA在小鼠心脏胚胎发育过程中呈现负性趋势.结论 Uc.40-的多水平保守性提示了TUC40-功能的保守性.TUC40-可能是通过调控Pbx1,在人和小鼠的心脏胚胎发育中发挥作用.