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血清蛋白质组学在晚期非小细胞肺癌EGFR-TKI疗效预测的初步研究

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前言

技术路线图

第一部分

临床资料

入选标准及采集内容

结果

讨论

第二部分 应用蛋白质组学技术筛选与EGFR-TKI疗效相关差异蛋白

资料与方法

结果

讨论

第三部分 差异蛋白质功能的初步分析及信息学分析

材料

方法

结果

讨论

参考文献

全文总结

综述:蛋白质组学在肺癌领域的应用

参考文献

发表文章

致谢

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摘要

背景:肺癌是目前造成肿瘤相关死亡最常见的肿瘤。肺癌中有80%是非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC),晚期非小细胞患者的5年生存率仅在16%左右。表皮生长因子受体-酪氨酸激酶抑制剂(Epidermal growth factorreceptor-Tyrosine kinase inhibitor,EGFR-TKI)应用于临床,使部分患者有了改善预后的机会。获得更精准更丰富的生物学标记,以指导药物应用是肺癌研究领域重要突破点。蛋白质组学已成为全球生命科学研究的重要手段。通过蛋白质组学的研究,能够筛选出肺癌的差异表达蛋白用以早期诊断,还有望阐明肺癌的发生发展、转移机制,评估疗效和预后,指导个体化治疗,提高生存质量。
  目的:本课题分别建立对EGFR-TKI敏感和耐药患者的血清二维电泳图谱,和无疾病进展生存(Progression-free survival,PFS)时间长短差异的患者的血清二维电泳图谱,以及所有患者在接受EGFR-TKI治疗不同阶段的二维电泳图谱,寻找血清差异蛋白,进一步探寻血清生物标记物用以筛选EGFR-TKI的优势及阶段性评价疗效。
  方法:本课题利用差异凝胶电泳(Difference gel electrophoresis,DIGE)和基质辅助激光解析飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption ionization,MALDI-TOF-MS)技术比较对EGFR-TKI敏感和耐药患者血清蛋白质组表达差异,比较PFS长短差异的患者的血清蛋白表达差异,并比较患者治疗前后血清蛋白表达的差异,对差异蛋白进行鉴定,从而筛选与EGFR-TKI疗效及预后相关的标记物。
  结果:初步发现共15个蛋白质在比较组中存在表达差异。各组比较得到了具有1.5倍以上有显著性意义的差异蛋白质点共282个,经质谱鉴定各组共得到差异蛋白点42个,排除组间及组内重复,共发现15个差异蛋白质。
  结论:
  1不同时间点的差异蛋白质是潜在的阶段性评价疗效的血清标记物。
  1.1纤维蛋白原α链(Fibrinogen alpha chain,FGA)、纤维蛋白原β链(Fibrinogenbeta chain,FGB)、细胞角蛋白10(typeⅠ cytoskeletal10,KRT10)在敏感组患者服用EGFR-TKI治疗之前高表达,而在服用EGFR-TKI疗效最显著时下降;补体C3(Complement C3)在敏感组患者服用EGFR-TKI治疗之前低表达,而在疗效最显著时升高。
  1.2细胞角蛋白10、纤维蛋白原α链和血清淀粉样蛋白P(Serum amyloidP-component,APCS)在PFS长组患者服用EGFR-TKI治疗之前高表达,在服药后下降;转铁蛋白(Serotransferrin,TF)和亚型1α-1-抗胰蛋白酶(Isoform1of Alpha-1-antitrypsin,SERDINA1)在PFS长组患者服用EGFR-TKI治疗之前低表达,在PD时升高。
  1.3血清淀粉样蛋白P在PFS短的患者中,接受EGFR-TKI治疗之前低表达,而在PD时高表达。
  2敏感和耐药之间的差异蛋白质可能是筛选应用EGFR-TKI优势人群的血清学标记物
  2.1纤维蛋白原γ链(Fibrinogen gamma chain,FGG)在敏感组患者服用EGFR-TKI治疗之前高表达,而在耐药组患者服用EGFR-TKI治疗之前低表达;纤溶酶原(Plasminogen,PLG)、细胞角蛋白1在敏感组患者服用EGFR-TKI治疗之前低表达,在耐药组患者服用EGFR-TKI治疗之前高表达。
  2.2纤溶酶原、细胞角蛋白1、细胞角蛋白10、补体C3、血红素结合蛋白(Hemopexin,HPX)、结合珠蛋白(Haptoglobin,HPR)在敏感组患者服用EGFR-TKI疗效显著时低表达,而在耐药组患者服用EGFR-TKI疾病进展时高表达;丛生蛋白(Clusterin,CLU)和血清淀粉样蛋白P敏感组患者服用EGFR-TKI疗效显著时低表达,在耐药组患者服用EGFR-TKI疾病进展时高表达。
  3 PFS长短之间的差异蛋白质是潜在的预测预后的血清差异蛋白
  3.1细胞角蛋白1和补体C3在PFS短的患者治疗之前低表达,而在PFS长组高表达,纤维蛋白原β链在PFS短的患者中高表达,而在PFS长的患者中低表达。
  3.2载脂蛋白E(Apolipoprotein E,APOE)在PFS长组患者应用EGFR-TKI治疗后高表达,而在PFS短组下降。

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