声明
摘要
第一章 绪论
1．1 植物生物钟研究进展
1．1．1 概述
1．1．2 拟南芥生物钟模型
1．1．3 植物生物钟转录水平的调控
1．1．4 植物生物钟转录后水平的调控
1．1．5 植物生物钟在生理代谢方面的作用
1．1．6 植物生物节律同步化研究进展
1．2 Illumina测序研究进展
1．2．1 有参考基因组测序
1．2．2 无参考基因组测序
1．3 研究目的及意义
1．4 研究内容与技术路线
1．4．1 研究内容
1．4．2 技术路线
第二章 野牛草相连克隆分株对不同光暗周期的生理响应
2．1 实验材料与方法
2．1．1 材料培养
2．1．2 不同光暗周期处理
2．1．3 实验方法
2．2 结果与分析
2．2．1 不同光暗周期下野牛草活性氧清除系统的活性变化
2．2．2 不同光暗周期下野牛草内源激素的含量变化
2．3 小结与讨论
2．3．1 野牛草分株活性氧清除系统对不同光暗周期的响应
2．3．2 野牛草分株内源激素对不同光暗周期的响应
第三章 野牛草日节律变化转录组测序及节律基因预测
3．1 实验材料与方法
3．1．1 实验材料
3．1．2 实验方法
3．2 结果与分析
3．2．1 RNA样品制备及质量评价
3．2．2 测序产量统计及质量评价
3．2．3 野牛草De novo序列组装
3．2．4 组装质量评价
3．2．4 蛋白数据库注释及功能分类
3．2．5 野牛草节律基因分析
3．3 小结与讨论
第四章 不同光暗周期下野牛草相连分株节律基因的表达分析
4．1 野牛草稳定内参基因筛选
4．1．1 材料培养
4．1．2 RNA提取和cDNA合成
4．1．3 野牛草内参基因引物设计及扩增效率检测
4．1．4 野牛草内参基因稳定性评价
4．2 野牛草节律基因表达分析
4．2．1 材料与方法
4．2．2 qRT-PCR验证节律基因的表达水平
4．2．3 不同光暗周期下野牛草相连分株HY5的表达分析
4．3 结果与分析
4．3．1 野牛草内参基因表达稳定性分析
4．3．2 RNA-seq与qRT-PCR分析野牛草节律基因表达水平
4．3．3 野牛草HY5表达模式分析
4．4 小结与讨论
第五章 结论与讨论
5．1 结论
5．2 讨论
5．2．1 野牛草分株活性氧清除系统对不同光暗周期的响应
5．2．2 野牛草分株的内源激素对不同光暗周期的响应
5．2．3 野牛草节律转录本的鉴定
5．2．4 野牛草稳定内参基因鉴定
5．2．5 野牛草节律转录本在不同光暗周期下的表达
5．2 展望
参考文献
在读期间的学术研究
致谢
