感染Lonsdalea quercina的欧美杨树皮组织中细菌多样性研究

摘要

欧美杨（Populus×euramencana）细菌性溃疡病是由Lonsdalea quercina引起的在欧美杨上新发生的溃疡症状的病害，为了与传统杨树溃疡病和细菌性溃疡病区分开，将其命名为欧美杨细菌性溃疡状烂皮病。近些年，该病害在我国河南、山东和天津等地的欧美杨人工林中大面积发生，造成危害严重。怎样有效的防控该病害的发生，已成为目前重要的研究课题。
　　本研究分别对河南省安阳市内黄县、濮阳市高新区和山东省济宁市梁山县三个不同地方的染病欧美杨细菌性溃疡型烂皮病的107杨(P.×euramencana cv.‘74/76')不同部位的树皮组织可培养细菌进行多样性研究分析，通过分离培养和计数、生理生化及分子鉴定手段，系统分析了无症部、病害延伸部、病健交界部和腐烂部组织的细菌组成、结构以及物种多样性情况，并重点比较分析不同部位优势种群异同，另外对分离到的5个未知种细菌菌株进行多相分类。本研究得出以下结论:
　　无症及染病107杨树皮具有丰富的细菌物种多样性，9个样品的36个组织块中分离到了52个属105个分类单元的细菌，主要集中在细菌域的厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)的α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）和γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）。
　　三个不同地方的可培养细菌种群中共同拥有的种群有14个属，分别是Brenneria、Cellulomonas、Corynebacterium、Enterobacter、Kocuria、Lactobacillus、Leucobacter、Leuconostoc、Lonsdalea、Microbacterium、Pseudomonas、Sanguibacter、Staphylococcus和Bacillus。
　　三个不同地方无症健康部分树皮共同拥有常见优势属是Sanguibacter和Microbacterium;病害延伸部分的共同优势属是Leucobacter和Microbacterium;腐烂部优势属是Lactobacillus;病健交界部的优势属是Lonsdalea。
　　四个不同分离部位的样品的细菌种类结构以及优势种群差别较大，无症健康部分的细菌种类结构以及优势种群是由植物常见内生菌组成;病害延伸部菌群中已经出现了少量的植物病原菌，且有发酵类菌群如Leuconostoc mesenteroides、Enterococcuscasseliflavus开始增多，Microbacterium arborescens等内生菌减少;病健交界部的菌群以病原菌Lonsdalea quercina为主，还包括其它发酵、植物致病菌类的菌群;而腐烂部的菌群则以发酵、促腐烂类的菌群为主，如Lactobacillus pentosus、Leuconostocmesenteroides，还包括少量植物病原菌。
　　染病107杨树皮组织蕴藏着许多未知物种，本研究系统鉴定了1个新属和4个新种，并暂时将其分别命名为Corticibacter populi gen.nov.，sp.nov.(17B10-2-12T=CFCC12099T=KCTC42091T)、Kurthiapopuli sp.nov.(10y-14T=CFCC11600T=KCTC33522T)、Leucobacter populi sp.nov.(06C10-3-11T=CFCC12199T)、 Leucobacter puyangensis sp.nov.(12C-7T=CFCC11901T)和Brenneriapopuli sp.nov.(D9-5T=CFCC11963T=KCTC42088T)。

目录

声明

摘要

第一章 绪论

1．1 引言

1．1．1 研究背景

1．1．2 植物染病组织细菌多样性研究进展

1．1．3 细菌多样性研究方法

1．1．4 细菌的分类鉴定研究

1．2 研究目的与意义

1．3 研究内容与技术路线

1．3．1 研究内容

1．3．2 技术路线

第二章 欧美杨树皮组织中可培养细菌多样性分析

2．1 材料与方法

2．1．1 试验材料

2．1．2 主要试剂和仪器

2．1．3 试验方法

2．2 结果与分析

2．2．1 欧美杨树皮组织中可培养细菌组成

2．2．2 欧美杨树皮组织中可培养细菌系统发育分析

2．2．3 欧美杨树皮组织中可培养细菌种群结构

2．2．4 欧美杨树皮组织中可培养细菌多样性指数

2．3 小结与讨论

第三章 细菌新种的多项分类研究

3．1 材料与方法

3．1．1 实验材料

3．1．2 试验方法

3．2 结果与分析

3．2．1 Corticibacter populi多项分类

3．2．2 Kurthia populi多项分类

3．2．3 Leucobacter属两个新种多项分类

3．2．4 Brenneria populi多项分类

3．3 小结与讨论

3．4 新种描述

3．4．1 Corticibacter populi的描述

3．4．2 Kurthia populi的描述

3．4．3 Leucobacter populi的描述

3．4．4 Leucobacter puyangensis的描述

3．4．5 Brenneria populi的描述

第四章 结论

参考文献

在读期间的学术研究

致谢