声明
摘要
注释说明清单
引言
1实验材料
1.1标本来源
1.1.1标本的采集运输与处理
1.1.2E6标本、序列来源信息
1.2材料
1.2.1实验主要试剂
1.2.2实验主要仪器
1.2.3实验主要耗材
2实验方法
2.1.1RD细胞复苏方法
2.1.2RD细胞传代方法
2.2E6标本的病毒接种与分离
2.3E6标本的核酸提取
2.4.1荧光定量RT-PCR所用探针和引物
2.4.2反应体系比例配置及循环条件
2.4.3实验对照设置
2.4.4实验结果分析
2.5.2RT-PCR反应体系及条件
2.5.4RT-PCR产物的核苷酸序列测定
2.5.5序列的拼接及整理
2.6E6生物信息学分析
2.6.1系统发育树的建立
2.6.2进化起源分析
2.6.3重组进化分析
3.1实时荧光定量(Real-time RT-PCR)鉴定结果
3.2E6病毒分离结果
3.3E6序列扩增结果
3.3.1琼脂糖凝胶电泳结果
3.3.2序列测定结果
3.4.1E6系统发育树的建立和基因型划分
3.4.2E6 VP1编码区进化起源分析
3.4.3三种基因型在中国大陆地区的传播
3.5 11株E6全基因组进化分析
3.5.1 11株E6全基因组序列同源性分析
3.5.2E6非编码区亲缘关系分析
3.5.3E6在P1编码区亲缘关系分析
3.5.4E6在P2、P3非结构蛋白编码区亲缘关系分析
3.611株E6全基因组序列重组分析
4讨论
5结论
参考文献
综述
致谢
作者简介及攻读硕士学位期间发表的学术论文
安徽理工大学;