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【6h】

2009--2018年中国大陆地区埃可病毒6型流行病学及基因特征分析

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摘要

注释说明清单

引言

1实验材料

1.1标本来源

1.1.1标本的采集运输与处理

1.1.2E6标本、序列来源信息

1.2材料

1.2.1实验主要试剂

1.2.2实验主要仪器

1.2.3实验主要耗材

2实验方法

2.1.1RD细胞复苏方法

2.1.2RD细胞传代方法

2.2E6标本的病毒接种与分离

2.3E6标本的核酸提取

2.4.1荧光定量RT-PCR所用探针和引物

2.4.2反应体系比例配置及循环条件

2.4.3实验对照设置

2.4.4实验结果分析

2.5.2RT-PCR反应体系及条件

2.5.4RT-PCR产物的核苷酸序列测定

2.5.5序列的拼接及整理

2.6E6生物信息学分析

2.6.1系统发育树的建立

2.6.2进化起源分析

2.6.3重组进化分析

3.1实时荧光定量(Real-time RT-PCR)鉴定结果

3.2E6病毒分离结果

3.3E6序列扩增结果

3.3.1琼脂糖凝胶电泳结果

3.3.2序列测定结果

3.4.1E6系统发育树的建立和基因型划分

3.4.2E6 VP1编码区进化起源分析

3.4.3三种基因型在中国大陆地区的传播

3.5 11株E6全基因组进化分析

3.5.1 11株E6全基因组序列同源性分析

3.5.2E6非编码区亲缘关系分析

3.5.3E6在P1编码区亲缘关系分析

3.5.4E6在P2、P3非结构蛋白编码区亲缘关系分析

3.611株E6全基因组序列重组分析

4讨论

5结论

参考文献

综述

致谢

作者简介及攻读硕士学位期间发表的学术论文

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著录项

  • 作者

    程文隽;

  • 作者单位

    安徽理工大学;

  • 授予单位 安徽理工大学;
  • 学科 病原生物学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 蔡茹;
  • 年度 2021
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S63P42;
  • 关键词

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