基于基因表达分解分析的乳腺肿瘤影像基因组学方法及其预后分析

目录

声明

第1章 绪论

1.1研究背景

1.2乳腺癌异质性概述

1.3乳腺癌预后概述

1.4影像基因组学概述

1.5论文的主要内容与创新点

1.6本章小结

第2章 乳腺动态增强影像数据与基因表达数据

2.1引言

2.2实验数据来源

2.3.1影像数据概述

2.3.2影像采集协议

2.4.1基因表达数据简介

2.4.2基因表达数据信息

2.5.1临床数据信息

2.5.2统计学分析

2.6本章小结

第3章 乳腺动态增强影像与基因表达数据预处理

3.1引言

3.2动态增强影像处理

3.2.1影像偏差校正

3.2.2感兴趣区域分割

3.2.3动态增强影像特征提取

3.3基因表达数据预处理

3.4本章小结

第4章 乳腺癌基因表达分解及其与预后的关联性研究

4.1引言

4.2研究方案概述

4.3基于混合物凸分析模型的基因表达数据分解

4.3.1 CAM模型无监督分解矩阵的基本原理

4.3.2基于CAM模型无监督分解基因表达数据

4.3.3模型选择

4.4基于表达分解的细胞亚群与预后的关联分析

4.4.1生存分析

4.4.2基于生存差异性的特征亚群选择

4.4.3特征亚群一致性聚类

4.4.4亚群聚类标签与预后的关联关系

4.4.5独立验证基因表达数据的亚群聚类标签

4.5.1亚群标记基因

4.5.2标记基因的KEGG通路富集分析

4.6本章小结

第5章 基于基因表达分解的影像基因组学方法及其预后分析

5.1引言

5.2研究方案概述

5.3基因表达数据与影像特征相关联

5.4特征选择与分类模型

5.4.1特征选择

5.4.2分类器设计

5.4.3模型评价指标

5.5基于影像标签的预后预测

5.5.1基于逻辑回归算法构建预后预测模型

5.5.2独立数据集验证影像标签

5.6本章小结

第6章 总结与展望

6.1工作总结

6.2 展望

致谢

参考文献

附录:作者在读期间发表的学术论文及参加的科研项目