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银杏SBP--box基因家族生物信息学分析及GbSBP1/9/13功能研究

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摘要

符号说明

第1章文献综述

1.1转录因子

1.2SBP转录因子与SBP-box基因家族

1.2.1SBP转录因子起源与特征

1.2.2SBP转录因子结构特征

1.2.3SBP-box基因家族的miRNA调控

1.3SBP转录因子研究进展

1.3.1SBP转录因子与生长发育

1.3.2SBP转录因子与逆境响应

1.3.3SBP转录因子与次生代谢产物生物合成

1.4本研究的目的与意义

1.4.1研究物种

1.4.2目的与意义

第2章银杏SBP-box基因家族生物信息学分析

2.1分析软件与方法

2.1.1分析网站及软件

2.1.2分析方法

2.2结果与分析

2.2.1银杏SBP-box基因家族成员鉴定

2.2.2银杏SBP-box基因家族成员进化关系分析

2.2.3蛋白保守基序分析(Motif分析)与保守结构域分析

2.2.4基因结构、复制事件分析及启动子顺式作用元件分析

2.2.5miRNA156靶位点预测

2.2.6银杏SBP-box基因家族与其他物种进化关系分析

2.2.7银杏SBP转录因子蛋白结构分析

2.2.8GbSBPs基因组织表达谱

2.3小结与讨论

2.3.1银杏SBP转录因子结构分析

2.3.3银杏SBP-box基因家族基因分析

2.3.4银杏SBP-box基因家族miRNA靶位点分析

2.3.5银杏SBP-box基因家族功能预测

第3章银杏SBP-box关键基因表达模式分析

3.1材料与方法

3.1.1实验材料

3.1.2试剂与仪器

3.1.3实验方法

3.2结果与分析

3.2.1关键基因响应非生物胁迫的表达模式分析

3.2.2激素处理下关键基因表达模式分析

3.2.3关键基因响应年龄的表达模式分析

3.3小结与讨论

3.3.1银杏SBP-box与非生物胁迫

3.3.2银杏SBP-box与植物激素

第4章GbSBP1/9/13基因功能研究

4.1材料与方法

4.1.1实验材料

4.1.2试剂与仪器

4.1.3实验方法

4.2结果与分析

4.2.1基因克隆与载体构建

4.2.2启动子克隆

4.2.3农杆菌转化

4.2.4拟南芥遗传转化

4.2.5银杏愈伤组织转化

4.2.6银杏种胚转化

4.3小结与讨论

4.3.1银杏SBP调控叶片生长与花发育

4.3.2银杏SBP调控次生代谢产物合成

第5章GbSBP9/13转基因银杏愈伤组织转录组学分析

5.1材料与方法

5.2.1转录组学概况

5.2.2差异基因的筛选

5.2.3差异基因富集分析

5.2.4植物类黄酮合成相关的差异基因分析

5.2.5植物激素相关的差异基因分析

5.2.6转录因子分析

5.3小结与讨论

结语

参考文献

附录

攻读学位期间取得的研究成果

致谢

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著录项

  • 作者

    苌棒;

  • 作者单位

    扬州大学;

  • 授予单位 扬州大学;
  • 学科 观赏园艺学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 金飚;
  • 年度 2021
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

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