西瓜噬酸菌bamC、bamE和hrcS基因功能分析

目录

声明

第一章 引言

1.1 瓜类细菌性果斑病

1.1.1 瓜类细菌性果斑病的传播

1.1.2 瓜类细菌性果斑病发病症状及病害循环

1.1.3 瓜类细菌性果斑病的防治措施及检测方法

1.2 西瓜噬酸菌

1.2.1 西瓜噬酸菌的特性及命名

1.2.2 西瓜噬酸菌的致病机理

1.3 Ⅲ型分泌系统

1.3.1 hrc基因簇

1.3.2 hrcS的研究进展

1.4 脂多糖

1.4.1 脂多糖运输系统

1.4.2 Bam 复合体

1.5 研究内容、目的及意义

1.6 技术路线

第二章 西瓜噬酸菌hrcS、bamC、bamE生物信息学分析

2.1 试验材料

2.2 方法

2.2.1 hrcS和bamC、bamE 基本信息

2.2.2 蛋白结构域预测分析

2.2.3 同源性比对及分析

2.3 结果

2.3.1 西瓜噬酸菌hrcS 和bamC、bamE基本信息

2.3.2 蛋白结构域预测及分析

2.3.3 hrcS和bamC、bamE 在西瓜噬酸菌全基因组定位分析

2.3.4 同源性比对及分析

2.4 小结与讨论

第三章 西瓜噬酸菌hrcS、bamC、bamE基因功能分析

3.1 试验材料及仪器设备

3.1.1 试验植物及培养条件

3.1.2 试验菌株及质粒

3.1.3 试验培养基及抗生素

3.1.4 试验试剂盒及反应酶

3.1.5 试验仪器及设备

3.1.6 试验数据统计分析

3.2 试验方法

3.2.1 引物设计

3.2.2 构建突变菌株

3.2.3 构建互补菌株

3.2.4 致病力测定

3.2.5 烟草过敏性反应测定

3.2.6 生长能力测定

3.2.7 运动能力测定

3.2.8 生物膜形成能力测定

3.2.9 胞外多糖检测

3.3 结果

3.3.1 重组载体的构建及验证

3.3.2 获得突变菌株

3.3.3 获得互补菌株

3.3.4 致病力测定结果

3.3.5 烟草过敏性反应测定结果

3.3.6 生长能力测定结果

3.3.7 运动性测定结果

3.3.8 生物膜形成能力测定结果

3.3.9胞外多糖检测结果

3.4 小结讨论

第四章 突变株相关基因表达量分析

4.1 材料

4.1.1 试验菌株

4.1.2 试验试剂及器材

4.2 试验方法

4.2.1荧光定量引物设计

4.2.2 总RNA提取的步骤

4.2.3 总RNA反转录成cDNA

4.2.4 荧光定量PCR

4.2.5 荧光定量PCR 数据分析

4.3 结果

4.3.1致病性相关基因表达量分析

4.3.2脂多糖运输途径相关基因表达量分析

4.4 小结讨论

第五章 结论及展望

5.1 获得了西瓜噬酸菌hrcS、bamC、bamE基因的相关生物学信息

5.2 获得了西瓜噬酸菌基因hrcS、bamC、bamE突变体及其互补菌株基因

5.3 基因hrcS、bamC、bamE调控着西瓜噬酸菌致病力、HR反应能力、运动能力等表型

5.4 Bam复合体与T3SS具有直接或间接的调控关系

5.5．展望与讨论

参考文献

致 谢