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【6h】

计算机辅助模拟、设计和分析α-L-鼠李糖苷酶结构域的功能

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第1章 引言

1. 1蛋白质工程概述

1.1.1非理性设计

1.1.2半理性设计

1.1.3 理性设计

1.2 蛋白质空间结构

1.2.1蛋白质空间结构的组成

1.2.2 蛋白质空间结构的预测

1.2.3 蛋白质模型的分子对接

1.3α-L-鼠李糖苷酶

1.3.1α-L-鼠李糖苷酶简介

1.3.2α-L-鼠李糖苷酶理化性质

1.3.3α-L-鼠李糖苷酶催化机理及晶体结构

1.4 研究背景与意义

1.5 研究主要内容

1.5.1 塔宾曲霉α-L-鼠李糖苷酶的结构模型构建及序列分析

1.5.2 结构域替换重组子的构建和研究

1.5.3 重组酶的酶学性质研究及结构域功能分析

第2章 塔宾曲霉α-L-鼠李糖苷酶序列分析及同源建模

2.1 引言

2.2 材料与方法

2.2.1 塔宾曲霉α-L-鼠李糖苷酶序列

2.2.2 应用软件与在线工具

2.2.3 分析数据库与服务器

2.2.4 塔宾曲霉α-L-鼠李糖苷酶同源建模

2.2.5 模型的建立及优化

2.2.6 模型的评价

2.2.7 分子对接

2.2.8 塔宾曲霉α-L-鼠李糖苷酶与白曲霉α-L-鼠李糖苷酶序列分析

2.2.9 酶活性分析

2.3 结果与讨论

2.3.1 塔宾曲霉α-L-鼠李糖苷酶二级结构及结构域分析

2.3.2 多模板建模模板搜索结果

2.3.3 多模板建模及优化

2.3.4 模型评价

2.3.5 分子对接

2.3.6 同源性分析

2.3.7 序列特性分析

2.3.8 理化特性预测

2.3.9 酶活比较

2.4 小结

第3章 结构域重组改变塔宾曲霉α-L-鼠李糖苷酶的酶活性

3.1引言

3.2材料与方法

3.2.1菌种与质粒

3.2.2试剂和仪器

3.2.3实验方法

3.3 结果与讨论

3.3.1 结构域互换位点的确定

3.3.2 AK-rhaαT重组质粒的构建

3.3.3 AK-rhaαT重组子的真核表达

3.3.4重组酶AK-rhaαT酶学性质分析

3.4本章小结

第4章 结构域βT1和βT2的替换及表达

4.1 引言

4.2 材料与方法

4.2.1 材料与仪器

4.2.2 实验方法

4.3 结果与讨论

4.3.1 AK-rhaαTβT1及AK-rhaαTβT2重组子三维结构模型构建及评分

4.3.2 AK-rhaαTβT1及AK-rhaαTβT2重组子质粒的构建

4.3.3 AK-rhaαTβT1和AK-rhaαTβT2重组子的真核表达

4.3.4 AK-rhaαTβT1及AK-rhaαTβT2重组酶的酶活测定及动力学分析

4.4 本章小结

第5章 重组α-L-鼠李糖苷酶的酶学性质

5.1 引言

5.2 材料与方法

5.3 结果与讨论

5.3.1 pH对重组酶酶活力及稳定性分析

5.3.2 温度对重组酶酶活力及稳定性分析

5.3.3 重组酶的底物特异性分析

5.3.4 重组酶氨基酸残基作用力分析

5.4 本章小结

第6章 结论与展望

6.1 结论

6.2 展望

致谢

参考文献

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著录项

  • 作者

    刘嘉男;

  • 作者单位

    集美大学;

  • 授予单位 集美大学;
  • 学科 食品加工与安全
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 李利君,洪清林;
  • 年度 2018
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 TP3TB3;
  • 关键词

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