纳他霉素优良菌株的选育及其基因差异表达分析

目录

声明

第1章 绪论

1.1 纳他霉素概述

1.1.1 纳他霉素的结构及性质

1.1.2 纳他霉素的抑菌机理

1.1.3 纳他霉素的应用

1.2 纳他霉素生物合成和代谢调控

1.2.1纳他霉素的生物合成基因簇

1.2.2 纳他霉素生物合成调控及策略

1.2.3纳他霉素基因工程菌的构建

1.3 提高纳他霉素产量的方法

1.3.1诱变育种

1.3.2 纳他霉素发酵工艺优化研究进展

1.3.3 纳他霉素培养基优化研究进展

1.3.4 诱导物添加研究进展

1.4 转录组测序研究进展

1.5 研究目的意义与内容

1.5.1 本研究目的意义

1.5.2 本研究的内容

第2章 纳他霉素优良菌株的选育

2.1 前言

2.2 试验材料和试验仪器

2.2.1 试验菌株

2.2.2 试验仪器

2.2.3 试验试剂

2.2.4 培养基

2.3 试验方法

2.3.1 培养方法

2.3.2 紫外诱变

2.3.3 ARTP诱变

2.3.4 DES诱变

2.3.5 最小抑菌浓度的确定

2.3.6 链霉素抗性平板筛选

2.3.7 突变率计算

2.3.8 纳他霉素测定

2.3.9 遗传稳定性检测

2.3.10 发酵曲线测定

2.3.11 数据处理

2.4 结果与讨论

2.4.1 紫外诱变结果

2.4.2 ARTP诱变结果

2.4.3 DES诱变结果

2.4.4 发酵曲线测定结果

2.5 本章小结

第3章 纳他霉素原位吸附及发酵工艺优化

3.1 前言

3.2 试验材料和仪器

3.2.1 试验菌株

3.2.2 试验仪器

3.2.3 试验试剂

3.3 试验方法

3.3.1 纳他霉素含量测定

3.3.2 大孔树脂预处理

3.3.3 大孔树脂含水量测定

3.3.4 静态吸附试验

3.3.5 静态解吸试验

3.3.6 静态吸附等温线的测定

3.3.7 大孔树脂原位发酵工艺的优化

3.3.8 单因素条件优化

3.3.9 响应面法优化

3.4 结果与讨论

3.4.1 大孔树脂含水量测定

3.4.2 树脂的静态吸附与解吸

3.4.3 树脂的吸附解吸动力学研究

3.4.4 静态吸附等温线的测定

3.4.5 大孔树脂原位发酵工艺的优化

3.4.6 单因素优化

3.4.7 响应面优化

3.5 本章小结

第4章差异菌株的转录组学分析

4.1 前言

4.2 试验材料与仪器

4.2.1 试验菌株

4.2.2 试验试剂

4.2.3 试验仪器设备

4.2.4 培养基

4.3 试验方法

4.3.1 样品制备

4.3.2 总RNA提取

4.3.3 转录组测序

4.3.4 基因水平表达分析

4.3.5 差异表达分析

4.3.6 qRT-PCR分析验证

4.4 结果与分析

4.4.1 取样时间点的确定

4.4.2 原始数据质量评估

4.4.3 基因表达分析

4.4.4 差异基因表达分析统计

4.4.5 差异基因的GO功能注释

4.4.6 差异基因的KEGG代谢通路分析

4.4.7 GO富集和KEGG富集分析

4.4.8 qRT-PCR验证

4.5 小结

第5章 结论

参考文献

致谢

攻读学位期间的研究成果