临床少见非发酵菌的MALDI-TOF MS鉴定及其药敏分析

摘要

第一部分：MALDI-TOF MS技术在鉴定临床少见非发酵菌中的应用
　　目的：评价基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）技术在快速鉴定临床少见非发酵菌中的应用价值。
　　方法：收集2013年7月～2016年10月安徽医科大学第一附属医院检验科分离的65株临床少见非发酵菌，包含痰液20株、尿液12株、血液9株、骨髓液9株、分泌物8株、腹透液2株、脑脊液1株、胆汁1株、其它体液3株。比较MALDI-TOF MS(VITEK MS)与Vitek2 Compact鉴定系统鉴定的准确性,结果均用16SrRNA序列分析验证。
　　结果：65株临床少见非发酵菌中，MALDI-TOF MS将64株（98.5%）鉴定到种水平，1株（1.5%）鉴定到属水平；Vitek2 Compact鉴定系统将58株（89.2%）鉴定到种水平，7株（10.8%）未能成功鉴定；65株少见非发酵菌均扩增到16SrRNA目的基因片段并成功测序，65株(100%)都鉴定到种水平。以16SrRNA序列分析为标准，MALDI-TOF MS和 Vitek2 Compact鉴定系统正确鉴定到种水平准确性分别为98.5%（64/65）和89.2%（58/65），两者差异有统计学意义（χ2=4.17，P<0.05）。
　　结论：同Vitek2 Compact鉴定系统相比，MALDI-TOF MS对临床少见非发酵菌的鉴定准确率高，可以作为临床微生物实验室鉴定的常规方法之一。
　　第二部分：临床少见非发酵菌对常见抗生素的敏感性分析
　　目的：了解临床分离的少见非发酵菌对18种常见抗生素的敏感性。
　　方法：除1株奥斯陆莫拉菌无药敏标准，其余64株临床少见非发酵菌均用VITEK2 COMPACT微生物鉴定系统配套的药敏卡片进行药物敏感性试验，K-B纸片法作为补充(CLSI2015)。用WHONET5.6软件进行数据分析。
　　结果：全部菌株对头孢哌酮/舒巴坦、哌拉西林/他唑巴坦、左旋氧氟沙星的耐药率都不高，分别为23.4%、26.6%、31.2%；对氨曲南、头孢唑林的耐药率最高，分别为79.7%、95.3%；而对其他13种常见抗生素的耐药率基本都在40%以上。27株木糖氧化无色杆菌对哌拉西林/他唑巴坦和头孢哌酮/舒巴坦的耐药率很低，分别为22.2%和25.9%；但对头孢唑啉、氨曲南、头孢曲松和呋喃妥因的耐药率都在90%以上；而且对其他12种常见抗生素的耐药率基本都在50%左右。
　　结论：64株少见非发酵菌对哌拉西林/他唑巴坦和头孢哌酮/舒巴坦的耐药率不高，而对其他常见抗生素都有很强的耐药性。医疗工作者应根据药敏实验结果合理使用抗生素治疗，控制耐药菌株的发展和传播。

目录

声明

英文缩写词表

引言

第一部分 MALDI-TOF MS技术在鉴定临床少见非发酵菌中的应用

1.材料与方法

1.1实验菌株

1.2实验仪器与试剂

1.3 质控和校准菌株

1.4 细菌分离培养及鉴定

1.5 统计学处理

2. 结果

2.1 质控菌株鉴定结果

2.2 65株实验菌株电泳结果

2.3 Vitek2 Compact 系统、MALDI-TOF MS 及16SrRNA序列分析鉴定结果

2.4 三种方法鉴定水平比较

2.5 三种鉴定方法的优缺点对比

3. 讨 论

4. 结论

第二部分 临床少见非发酵菌对常见抗生素的敏感性分析

1.材料和方法

1.1菌株来源

1.2药物敏感实验

1.3结果判读和数据分析

2.结果

2.1菌株分布

2.2 菌株来源分布及标本构成

2.3 菌株的科室分布

2.4 菌株的药敏分析结果

3. 讨论

4.结论

参考文献

附录

致谢

综述:MALDI-TOFMS应用于不动杆菌检测的研究进展