声明
摘要
符号及缩略语的中英文对照
绪论
第一章文献综述
1．1半滑舌鳎
1．2牙鲆
2鱼类分子育种技术研究进展
2．1分子标记辅助育种
2．2性状相关基因座定位
2．3全基因组关联分析
2．4基因组选择
3鱼类主要经济性状研究现状
3．1生长性状
3．2变态
3．3抗病性状
3．4抗逆性状
1．5本研究的目的意义
第二章半滑舌鳎白化相关基因座定位
1实验材料
1．1家系材料
1．2仪器与试剂
2实验方法
2．1半滑舌鳎基因组DNA的提取
2．2表型数据的处理
2．3 QTL初步定位所用微卫星标记的选择
2．4 PCR扩增
2．5聚丙烯酰胺凝胶电泳
2．6基因分型结果的读取
2．7遗传连锁图谱的构建
2．8各表型性状的QTL初步定位
3实验结果
3．1表型性状
3．2选用标记
3．3遗传连锁图谱的构建及定位
3．4单标记分析
3．5半滑舌鳎定位结果与基因组的结合
3．6半滑舌鳎白化相关基因的富集分析
4讨论
4．1表型的选取
4．2白化相关基因座
4．3白化相关基因
第三章半滑舌鳎眼睛偏转相关基因座定位
1实验材料
1．1家系材料
1．2仪器与试剂
2实验方法
2．1半滑舌鳎及牙鲆基因组DNA的提取
2．2表型数据的处理
2．3 QTL初步定位所用微卫星标记的选择
2．4 PCR扩增
2．5聚丙烯酰胺凝胶电泳
2．6基因分型结果的读取
2．7遗传连锁图谱的构建
2．8各表型性状的QTL初步定位
3实验结果
3．1表型性状
3．2选用标记
3．3遗传连锁图谱的构建及定位
3．4单标记分析
3．5半滑舌鳎定位结果与基因组的结合
4讨论
4．1表型性状的选取
4．2定位结果的相互验证
4．3定位结果与基因组的结合
第四章rps6kb2的克隆以及在鲆鲽鱼类变态过程中的表达模式
1实验材料
1．1实验仪器
1．2实验试剂
1．3试剂配置方法
1．4实验耗材
2实验方法
2．1样品总RNA提取及cDNA合成
2．2半滑舌鳎rps6kb2基因已知序列验证
2．3半滑舌鳎rps6kb2基因全长cDNA克隆
2．4 rps6kb2基因序列分析
2．5 rps6kb2基因进化分析
2．6 rps6kb2所在信号通路的分析
2．7 Real-time qPCR分析
2．8整体原位杂交
3实验结果
3．1半滑舌鳎不同变态时期形态学特征
3．2 rps6kb2所在信号通路的分析
3．3半滑舌鳎rps6kb2基因全长及序列分析
3．4半滑舌鳎rps6kb2基因进化分析
3．5半滑舌鳎和牙鲆不同变态时期rps6kb2基因表达
3．6半滑舌鳎rps6kb2基因整体原位杂交
4讨论
4．1 rps6kb2基因的功能、通路与鲆鲽鱼类变态的联系
4．2 rps6kb2基因的克隆与分析
4．3 rps6kb2在鲆鲽鱼类变态过程中的表达
第五章牙鲆抗迟缓爱德华氏菌病基因组选择
1实验材料
1．1实验用鱼
1．2迟缓爱德华氏菌
2实验方法
2．1牙鲆家系的建立
2．2牙鲆家系迟缓爱德华氏菌感染实验
2．3牙鲆抗迟缓爱德华氏菌病基因组选择样品的选取
2．4参考群体和候选群体的测序和基因型的整理
2．5牙鲆抗迟缓爱德华氏菌基因组选择的计算
3实验结果
3．1牙鲆家系的建立
3．2牙鲆迟缓爱德华氏菌感染
3．3牙鲆基因组选择样品的选取
3．4基因组选择样品的重测序
3．5牙鲆基因组选择计算SNP位点效应
3．6牙鲆基因组选择算法的交叉验证
3．7参考群体基因组估计育种值分析
3．8候选群体基因组估计育种值的分析
3．9基因组选择在“鲆优2号”培育中的应用
4讨论
4．1基因组选择表型的选取
4．2基因组选择结果的验证
4．3不同标记密度对基因组选择计算结果的影响
第六章半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病基因组选择
1实验材料
1．1实验用鱼
1．2哈维氏弧菌
2实验方法
2．1半滑舌鳎家系的建立
2．2半滑舌鳎家系哈维氏弧菌感染实验
2．3半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病基因组选择样品的选取
2．4参考群体和候选群体的测序和基因型的整理
2．5半滑舌鳎抗哈维氏弧菌病基因组选择的计算
3实验结果
3．1半滑舌鳎家系的建立
3．2半滑舌鳎哈维氏弧菌感染
3．3半滑舌鳎基因组选择样品的选取
3．4基因组选择样品的重测序
3．5半滑舌鳎基因组选择计算SNP位点效应
3．6参考群体基因组估计育种值分析
3．7半滑舌鳎基因组选择算法的交叉验证
3．8候选群体基因组估计育种值的分析
3．8基因组选择结果在半滑舌鳎抗病育种中的应用
4讨论
4．1基因组选择与传统分子标记辅助育种方式的比较
4．2基因组选择在畜牧和水产中应用的比较
4．3基因组选择算法的选取
4．4半滑舌鳎和牙鲆基因组选择的比较
全文总结
全文创新点
参考文献
致谢
攻读学位期间的科研成果
南京农业大学;
