声明
缩写词中英文对照
第一章 绪论
1.1器官移植概述
1.2国内外器官移植发展
1.3器官移植与感染
1.3.1移植术后感染的危害性
1.3.2影响移植后感染的因素
1.4器官移植术后主要病原微生物
1.4.1移植术后感染发生时间
1.4.2病原微生物来源
1.4.3肾移植术后BKV感染
1.4.4移植术后耐药菌株感染
1.5 多重PCR检测临床病原微生物
1.6 二代测序技术检测感染
1.6.1二代测序简介
1.6.2 二代测序技术检测病原微生物感染
1.6.3二代测序技术检测器官移植术后病原体
1.7 选题思想与研究意义
1.8 研究内容及技术路线
1.8.1 研究内容
1.8.2技术路线图
第二章 二代测序技术检测器官移植术后感染
2.1 实验材料与方法
2.1.1实验耗材
2.1.2 实验仪器
2.1.3 样本来源
2.1.4 病原微生物参考基因组数据库构建
2.1.5 样本采集
2.1.6 DNA提取
2.1.7 DNA定量
2.1.8 文库构建
2.1.9 二代测序
2.2 结果与讨论
2.2.1患者样本WGS测序可有效检出病原微生物的DNA序列
2.2.2 杂交捕获测序可有效检出患者样本内的病原微生物DNA序列
2.2.3 不同样本类型中病原微生物检出类别存在差异
2.2.4 WGS及杂交捕获检测器官移植术后病原微生物结果存在差异
2.2.5 器官移植术后主要病原微生物的筛选
本章小结
第三章 器官移植术后主要病原微生物检测
3.1 材料与方法
3.1.1 实验耗材与仪器
3.1.2样本来源
3.1.3样本采集
3.1.4病原菌DNA提取
3.1.5 文库构建
3.1.6上机测序
3.1.7根据测序结果的病原菌拷贝数计算公式
3.2结果与讨论
3.2.1 8种病原微生物于患者样本中拷贝数分布存在差异
3.2.2 8种目标病原微生物于不同分组中分布差异
3.2.3 使用宏基因组测序检测8种病原微生物测序结果存在偏向性
3.2.4 临床验证
本章小结
第四章 多重PCR体系检测器官移植术后主要病原微生物
4.1 材料及方法
4.1.1实验耗材及仪器
4.1.2样本来源
4.1.3样本采集
4.1.4 DNA提取
4.1.5 多重PCR引物设计
4.1.6 多重PCR
4.1.7 二代测序
4.2 结果与讨论
4.2.1 所设计引物特异性较强
4.2.2 所设计引物灵敏度较高
4.2.3 多重PCR产物测序质量较高
4.2.4 临床验证
本章小结
第五章 BKV于肾移植术后患者血液分布情况探究及产碳青霉烯耐药型肺炎克雷伯菌检测
5.1 材料与方法
5.1.1实验耗材与仪器
5.1.2样本来源
5.1.3外周血DNA的提取
5.1.4 巢式PCR扩增全血样本中BKV-DNA序列
5.1.5 巢式PCR扩增血浆、PBLs中的BKV-DNA序列
5.1.6 肺炎克雷伯菌内部转录间隔区（ITS）及产碳青霉稀酶基因（KPC）引物设计及特异性验证
5.1.7肺泡灌洗液DNA的提取
5.1.8 PCR扩增
5.2 结果与讨论
5.2.1全血样本中获得了预期BKV-DNA扩增产物
5.2.2 血浆及PBLs样本中BKV-DNA扩增结果
5.2.3 肺炎克雷伯菌内部转录间隔区（ITS）及KPC基因目标区域均出现阳性扩增
5.2.4 KPC引物特异性强
本章小结
结论与展望
参考文献
致谢
附表
江苏大学;
