基于进化多目标优化的疾病模块识别算法研究

目录

声明

第一章 绪论

1.1 研究背景与意义

1.2 国内外研究现状

1.2.1 传统疾病模块识别算法

1.2.2 基于进化多目标优化的疾病模块识别算法

1.2.3 可分类疾病模块识别算法

1.3 本文的工作与安排

第二章 疾病模块识别相关理论

2.1 相关生物数据

2.1.1 生物分子网络

2.1.2 疾病相关数据

2.2 算法评价机制

2.2.1富集显著性

2.2.2分类性能指标

2.2.3功能富集分析

2.3 进化多目标优化算法相关理论

2.3.1 进化多目标优化算法的目标函数

2.3.3 基于支配关系的进化多目标优化算法选解策略

2.4 本章小结

第三章 基于个体特异性网络的进化多目标优化疾病模块识别算法

3.1 算法思想

3.2 算法流程

3.2.1 网络构造策略

3.2.2 疾病模块识别

3.3 实验与分析

3.3.1 实验设置

3.3.2 性能对比试验

3.3.3 网络构造策略的有效性分析

3.3.4 疾病模块的生物学分析

3.4 本章小结

第四章 基于进化多目标优化的可分类疾病模块识别算法

4.1 算法思想

4.2 算法流程

4.2.1 EMOCDMI的初始化策略

4.2.2 EMOCDMI的交叉变异算子

4.2.3 算法评价方法和目标函数

4.3 实验与分析

4.3.1 实验设置和实验数据集

4.3.2 实验结果与分析

4.4 本章小结

结论

工作总结

未来展望

参考文献

攻读硕士学位期间取得的学术成果

攻读硕士学位期间参与的科研项目

致谢