染色体4q25区痛风易感基因的筛查

摘要

目的：台湾学者与本课题组均通过研究发现染色体4q25区与原发性痛风的发病密切相关。本研究通过DNA芯片的方法，寻找该区域内与原发性痛风相关的基因多态性位点，探讨该区域与原发性痛风发病的相关性。
　　 方法：收集原发性男性痛风患者480例，男性正常对照480例。取研究对象外周抗凝血，QIAGEN试剂盒提取基因组DNA。应用hapmap数据库寻找tagSNP；Haploviewer软件检验SNP位点的Hardy-Weinberg平衡，确认研究对象选取的随机性；GoldenGate DNA芯片反应进行基因分型；x2检验比较不同组别基因型频率，确定该区域内与原发性痛风相关的SNP位点。
　　 结果：
　　 1.染色体4q25基因序列分析结果根据hapmap数据库及haploview软件运行结果，最终选取96个tagSNP(在选择SNP时要求最小等位基因频率最低0.05；R2最低值不低于0.8)。
　　 2.痛风组与对照组基因型频率比较根据芯片数据分析结果，全部芯片的call rate值为99.9％，在病例和对照组中，以基因为单位，有4个基因中各有一个tag SNP与痛风病的发病相关。
　　 根据Bonferroni correction的原则，96位点芯片显著性差异的P值应该小于5.2*10-1。通过校正，只有ELOVL6基因的rs12504538与痛风病的发病相关。
　　 结论：中国汉族男性痛风人群ELOVL6基因rs12504538位点多态性与原发性痛风关节炎发病密切相关，尚需进一步扩大样本验证，并通过功能试验进一步证实该位点多态性是否与痛风的发病有关。