绵羊Leptin基因SNPs多态性及其与生长发育性状的相关性分析

摘要

本研究是以典型群随机抽样方法采集3个国外引进品种(包括无角陶赛特121头、萨福克72头、得克塞尔73头)和国内品种滩羊89头。利用PCR-SSCP技术对这4个绵羊品种358个个体Leptin基因2、3外显子进行多态性分析，以及该基因与生长发育性状间的相关性研究；同时利用MEGA．4生物软件构建绵羊、山羊、水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡等物种间的系统发生树。结果如下： 1.在Leptin基因外显子2上未发现突变；内含子2上存在A99G、G115A、C150T、C171T4个SNP位点，G115A和C171T为两个新发现的多态位点；外显子3上检测到G271A、C316A、G387T 3个SNP位点；还新发现4种双突变类型，分别是A99G和C150T、A99G和G115A、A99G和C316A、A99G和G387T。C171T位点仅存在与无角陶赛特群体中，为无角陶赛特特有的SNP位点；C316A、A99G+G115A和A99G+C316A位点为得克塞尔群体特有的SNP位点；G387T和A99G+G387T位点仅存在于滩羊群体，为滩羊群体特有的品种特性。 2.各SNP位点及双突变位点在各群体中突变频率都较低，在滩羊群体中检测到的SNPs比较丰富。得克塞尔群体A99G位点和滩羊群体G271A位点的基因型频率偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)，其他群体各位点基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。在A99G、C150T和．A99G+C150T位点，不同品种之间基因型分布差异显著。 3.绵羊外显子2、3共441 bp与山羊、水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡相应核苷酸序列同源性比较及ME、MP和NJ三种系统聚类方法构建的各物种间系统进化树结果一致：绵羊与山羊亲缘关系最近，遗传距离最小；而与水牛、奶牛、猪、人、小家鼠、鸡亲缘关系依次变远，同源性也依次降低，遗传距离亦随之增加。 4.在影响生长发育性状指标的各因素中，品种效应占主导地位，品种与生长发育性状间存在极显著相关性(P<0.01)，性别对生长发育性状影响不显著(P>0.05)，各SNPs位点基因型对各生长发育性状指标影响不显著(P>0.05)。

目录

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摘要

第一章文献综述

1 Leptin基因的研究进展

1.1 Leptin基因的结构

1.2 Leptin的生物学功能及作用机制

1.3 Leptin在畜牧业上的应用前景

2四个绵羊品种资源概况

3 PCR-SSCP技术

4遗传进化分析

5研究目的和意义

第二章绵羊Leptin基因多态性检测及序列分析

1材料与方法

1.1试验动物

1.2主要仪器与药品

1.3试验方法

1.4引物设计

1.5目的片段检测

1.6分析工具和软件

1.7数据分析

2结果与分析

2.1 SNPs多态性检测

3讨论

3.1 SNPs分析

3.2群体间基因型分布

第三章绵羊Leptin基因的遗传进化分析

1材料与方法

1.1试验材料

1.2分析工具和软件

2结果与分析

2.1绵羊与其他物种间Leptin基因编码区核苷酸序列比较分析

2.2绵羊与其他物种间的系统进化分析

3讨论

第四章绵羊Leptin基因SNPs多态性与生长发育性状的相关分析

1材料与方法

1.1试验材料

1.2分析工具和软件

1.3数据分析

2结果与分析

2.1生长发育性状相关分析

3讨论

结论

参考文献

致谢

攻读硕士期间撰写或发表的论文