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论文说明:缩略语
声明
1前言
1.1古菌概述
1.1.1古菌的多样性及分类
1.1.2古菌的细胞结构、遗传特性及基因组特征
1.1.3古菌的应用价值
1.1.4极端嗜热古菌和硫化叶菌概述
1.2 DNA复制起始
1.2.1 DNA复制原点
1.2.2原点识别复合物ORC和Cdc6蛋白
1.2.3 DNA复制性解旋酶-微染色体维持蛋白(MCM)
1.2.4单链DNA结合蛋白
1.2.5其它DNA复制起始蛋白
1.2.6 DNA复制的起始及其调控
1.3蛋白质/核酸相互作用研究方法进展
1.3.1 DNase I足迹试验
1.3.2凝胶电泳迁移率分析
1.3.3染色质免疫沉淀技术
1.3.4核酸适体技术
1.3.5表面等离子共振技术
1.3.6扫描探针显微镜技术
1.4蛋白质和蛋白质相互作用研究
1.4.1蛋白质亲和纯化分析
1.4.2免疫共沉淀
1.4.3交联技术
1.4.4酵母双杂交系统
1.4.5细菌双杂交系统
1.5本研究的选题依据、目的及内容
1.5.1选题依据
1.5.2研究的目的及意义
1.5.3本研究的思路和内容
2材料和方法
2.1材料
2.1.1供试菌株
2.1.2供试质粒
2.1.2酶、试剂和试剂盒
2.1.3寡核苷酸
2.1.4培养基
2.1.5抗生素
2.1.6缓冲液与试剂的配制
2.2方法
2.2.1 S.solfataricus P2的培养
2.2.2 S.solfataricus P2基因组DNA提取
2.2.3 PCR扩增反应
2.2.4分子生物学基本操作方法
2.2.5表达载体的构建
2.2.6蛋白的表达、纯化及蛋白浓度测定
2.2.7寡核苷酸底物的同位素标记
2.2.8凝胶电泳迁移率试验(EMSA)
2.2.9 Pull-down assay
2.2.10 His-tag 融合蛋白抗血清的制备
2.2.11 His-tag融合蛋白特异性抗体的亲和纯化
2.2.12 Western-blotting 检测抗原抗体的特异性结合
2.2.13 细菌双杂交载体的构建及相互作用蛋白的筛选
2.2.14 Native-PAGE
3结果与分析
3.1 SsoCdc6与复制原点特异性DNA的相互作用研究
3.1.1 SsoCdc6-1、-2和-3氨基酸序列分析、结构预测和SsoCdc6-1KA、Cdc6-1ΔC、SsoCdc6-3KA、Cdc6-3 AC突变体的设计
3.1.2 His-tag SsoCdc6-1和-3原核表达载体的构建
3.1.3 SsoCdc6-1和-3 C-末端缺失突变原核表达载体的构建
3.1.4 SsoCdc6-1和-3定点突变表达载体的构建
3.1.5 His-tag融合蛋白在大肠杆菌中的表达和纯化
3.1.6蛋白质浓度的测定
3.1.7定点突变蛋白的包涵体表达及其二级结构的预测
3.1.8原点特异性DNA底物的设计
3.1.9 SsoCde6差异性结合不同的原点特异性DNA底物
3.1.10小结
3.2 SsoCdc6之间的功能和物理相互作用研究
3.2.1表达SsoCdc6-1、-2、-3天然蛋白的重组表达载体的构建
3.2.2三个SsoCdc6及C-末端缺失突变体编码基因在双杂交载体的克隆
3.2.3 SsoCdc6天然蛋白在大肠杆菌中的表达和纯化
3.2.4 SsoCdc6之间的功能相互作用
3.2.5 SsoCdc6 之间的物理相互作用
3.2.6小结
3.3 SsoCdc6与SsoMCM之间的功能和物理相互作用研究
3.3.1表达天然蛋白SsoMCM的原核表达载体的构建
3.3.2天然蛋白SsoMCM与His-tag SsoMCM的表达和亲和纯化
3.3.3 SsoMCM和oriC2序列特异性DNA底物之间的相互作用
3.3.4 SsoMCM和SsoCdc6的功能相互作用
3.3.5 SsoMCM和SsoCde6的物理相互作用
3.3.6小结
3.4 SsoCdc6与S.solfataricus DNA聚合酶(polB1)和单链结合蛋白(SSB)之间的相互作用研究
3.4.1 His-tag SsopolB1原核表达载体的构建
3.4.2 ssopolbl在细菌双杂交载体的克隆
3.4.3 His-tag SsoSSB原核表达载体的构建
3.4.4 ssossb在细菌双杂交载体pBT和pTRG的克隆
3.4.5 SsopolB1和SsoSSB His-tag融合蛋白的表达和亲和纯化
3.4.6细菌双杂交筛选SsoCdc6和SsopolB1的物理相互作用
3.4.7细菌双杂交筛选SsoCdc6和SsoSSB的物理相互作用
3.4.8小结
4讨论
4.1 SsoCdc6 N-端存在特异序列在结合原点DNA过程中起重要作用?
4.2三个SsoCdc6如何调控DNA复制的起始?
4.3 SsoCdc6之间相互作用不稳定?
4.4 SsoCdc6-2是SsoMCM的加载者?
4.5 SsoCdc6-1、-2和-3在DNA复制起始过程中发挥不同的作用?
4.6 SsoCdc6-3在DNA复制起始后期和延伸阶段也发挥一定的作用?
5本研究的创新性成果与下一步工作设想
5.1本研究的创新性成果
5.2下一步工作设想
参考文献
论文发表情况
致谢