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仙游县胃癌人群幽门螺杆菌感染情况及NF-κB非经典信号通路相关基因SNPs与胃癌关联性研究

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第一部分 胃癌人群幽门螺杆菌感染情况与其危险因素分析

前言

1研究对象与方法

2结果

3讨论

4小结

第二部分 NF-κB非经典信号通路相关基因SNPs与胃癌的相关性研究

前言

1研究对象与方法

2结果

3讨论

4小结

第三部分 基因-基因、基因-环境的交互作用分析

前言

1实验材料与方法

2结果

3讨论

4小结

优势与不足

结论

参考文献

综述:NF-κB非经典信号通路与肿瘤关系的研究进展

致谢

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摘要

目的:探讨仙游县地区胃癌人群幽门螺杆菌感染的分布情况,发现其可能存在的环境危险因素;研究NF-κB非经典信号通路相关节点基因多态性与胃癌、贲门癌、非贲门胃癌的关联性;挖掘基因-基因、基因-环境之间可能存在的交互作用及其大小。
  方法:
  1.胃癌人群幽门螺杆菌感染及其危险因素的现况调查,收集福建省仙游县医院经组织病理学确诊的新发胃癌共622例,选取进行幽门螺杆菌检测结果资料完整的病人480例,采用胃镜下快速尿素酶法检测胃癌人群幽门螺杆菌感染情况,通过问卷调查获取患者幽门螺杆菌感染危险因素等信息,采用卡方检验分析不同胃癌部位胃癌人群中幽门螺杆菌危险因素的分布情况,运用非条件Logistic回归分析法进行环境多因素分析。
  2.应用生物信息学技术和高通量数据结果筛选NF-κB非经典信号通路相关节点基因多态性位点。采用1:1病例对照研究设计方法,按性别、年龄、居住地对550例胃癌病例进行健康人群匹配,采用分子流行病学方法,采集病例与对照人群各5ml血液样本,提取DNA,应用Sequenom技术平台检测基因的位点分型,运用条件Logistic回归分析各基因位点与胃癌、贲门癌、非贲门癌易感性的关系。
  3.通过条件logistic回归分析,622例胃癌病例与622例健康对照中具有统计学意义的环境危险因素,联合采用广义多因子降维法、logistic回归分析并且结合叉生分析原理探讨不同胃癌部位类型中基因-基因、基因-环境可能存在的交互作用。
  结果:
  1.胃癌人群幽门螺杆菌感染情况以及危险因素的分布特征:调查的480例胃癌患者中,HP阳性患者为238例,阳性率为49.6%,仙游县胃癌人群中男性幽门螺杆菌阳性率为48.4%,女性幽门螺杆菌阳性率为52.7%,45~55岁胃癌人群幽门螺杆菌感染率最高(55.6%),幽门螺杆菌危险因素有:饮用非自来水水源、最早接触农药年龄<20岁、重度吸烟、食用辛辣食物、大量食用牛羊肉、腌菜、慢性萎缩性胃炎病史、肿瘤家族史、对家庭现状不满意;保护因素有:食用鲜蛋、新鲜鱼虾、贝壳螺类、海带紫菜、豆制品、新鲜水果、洋葱大葱。
  2.NF-κB非经典信号通路相关节点基因多态性位点与胃癌的关联性:CD40基因rs3765459位点基因多态性与胃癌易感性相关,AA为不良基因型,是携带GG基因型的人群患胃癌风险的1.62倍,这种差异在非贲门胃癌中同样可见;TNFRSF11A基因rs1805034位点(TC+CC)显性模型可减低非贲门胃癌的患病风险(OR=0.661,95%CI:0.469,0.931)。TRAF3基因Grs8022770Crs12878111单体型可降低胃癌、贲门癌、非贲门胃癌的患病风险,OR值分别为:0.105,0.207,0.043。
  3.基因-基因,基因-环境联合作用以及交互作用分析:rs7290134与食物较硬联合作用结果显示,携带GA或GG基因型且食用干硬食物的人群患胃癌的风险是携带AA基因型且食用软质食物人群的4.577倍,95%CI:2.776~7.545;同样携带AA基因型,食用干硬食物人群患胃癌的风险是食用软质食物人群的4.490倍,95%CI:3.166~6.369。rs1805034位点与食物软硬联合作用中,携带野生纯合TT基因型且食用干硬食物的人群患非贲门胃癌的风险性为携带TC或者CC基因型且食用软质食物的人群患非贲门胃癌的风险性增加(OR95%CI:6.099(3.406,10.919))。同样携带TT基因型,食用干硬食物人群患胃癌的风险是食用软质食物人群的4.201倍(2.440,7.231);rs1805034位点与吸烟包年数的联合作用中,携带rs1805034 TT基因型且吸烟包年≥20的人群患非贲门胃癌的风险性增加(OR=1.810,95%CI:1.007~3.252)。rs7290134与食物较硬联以及rs1805034位点与食物软硬、吸烟包年之间不存在相乘、相加交互作用。
  结论:
  1.仙游县地区胃癌人群幽门螺杆菌阳性率为49.6%,处于福建地区中等水平。幽门螺杆菌危险因素有:最早接触农药年龄<20岁、重度吸烟、食用辛辣食物、大量食用牛羊肉、腌菜、饮用非自来水水源、慢性萎缩性胃炎病史、肿瘤家族史、对家庭现状不满意;保护因素有:食用鲜蛋、新鲜鱼虾、贝壳螺类、海带紫菜、豆制品、新鲜水果、洋葱大葱。
  2.NF-κB非经典信号通路CD40基因rs3765459位点、TNFRSF11A基因rs1805034位点与胃癌易感性相关,TRAF3基因Grs8022770Crs12878111单体型可降低胃癌发病风险,rs3765459位点以及Grs8022770Crs12878111单体型与胃癌的关联性此前尚未见报道。
  3.环境-基因之间存在联合交互作用,携带TNFRSF13C rs7290134 GA或GG基因型以及硬食的人群患胃癌危险性增加,该位点此前尚未见报道。TNFRSF11A rs1805034TT基因型联合硬食或者吸烟包年≥20可增加患非贲门胃癌的危险性,提示可通过加强对环境危险因素的干预措施控制高危人群患病的风险性,从而形成一个全面具体的胃癌防控网络。

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