华东地区虎纹蛙三个地理种群的遗传多样性与遗传结构研究

摘要

虎纹蛙(Hoplobatrachus rugulosus)属于两栖纲无尾目叉舌蛙科虎纹蛙属物种,广泛分布于中国南方地区。由于生境的片段化和丧失以及过度的人为捕杀,其野外种群分布范围和数量都在急剧的缩小。本研究利用GenBank数据库和本实验室发表的7对虎纹蛙特异性微卫星(Microsatellite)引物,研究测定了3个虎纹蛙地理种群(福建种群、安徽种群和江西种群)的遗传多样性和遗传结构。
　　 研究结果表明:
　　 1、7个微卫星座位均表现出较高的遗传多样性。在106个样品中共检测到55个等位基因,各位点等位基因的数目在6至10个之间。每个基因座上的平均等位基因为7.86个。所有位点的多态信息含量均大于0.5,平均PIC为0.825。各位点观测杂合度和期望杂合度分别在在0.637-0.840和0.811-0.872之间,平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.739和0.849。
　　 2、对所有位点进行哈迪温伯格平衡和连锁不平衡检测,结果显示有61.9％的位点表现为显著或极显著的偏离哈迪温伯格平衡(P<0.01或P<0.05),而各位点间并未表现出明显的连锁不平衡现象。P值均大于0.05。
　　 3、通过IAM、TPM或SMM三种突变模型对各种群瓶颈效应进行检测,结果显示:江西、安徽和福建3个种群近期都经历种群瓶颈效应。
　　 4、利用固定指数(Fst)和Fishez’s确切性检验测定了三个种群间的遗传分化程度,结果发现微卫星位点在各种群间并未发生明显的遗传分化,P值均大于0.001。
　　 5、根据Nei's无偏差遗传距离和构建的UPGMA聚类图显示,安徽和江西种群的遗传距离最近,为0.1146,安徽和福建种群的遗传距离最远,为0.1437。
　　 6、对三个种群基因流的研究显示:Nm搠值均大于1,各地理种群间的基因流较高。同时各地理种群的Fis正值较多,说明在各种群内部的个体间存在着广泛的近交现象。