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生物信息学筛选的合成小肽抑制VEGF诱导小鼠角膜新生血管实验研究

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摘要

前 言

第一部分生物信息学分析筛选小肽

第二部分小鼠角膜微囊袋模型的建立

第三部分合成小肽对小鼠角膜新生血管作用研究

参考文献

综述 生物信息学在眼科的应用

致 谢

生物信息学筛选的合成小肽抑制小鼠角膜新生血管实验研究

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摘要

血管新生,即在预先存在的血管中长出新生毛细血管的过程.它是多种致盲性新生血管性眼病的共同病理生理基础.血管新生严格地受到促血管因子和抑血管因子平衡的调控.这种平衡的打破,能够促发血管新生的细胞转导信号,引起血管内皮细胞的增生、迁移和存活,从而导致病理性的血管新生.血管内皮细胞生长因子(vascular endothelial growth factor,vEGF),作为复杂的血管新生瀑布反应的中心介质和强大的通透性因子,是迄今为止唯一被证实仅对内皮细胞特异性作用的促血管因子,并在血管形成中发挥关键作用. Kringle结构域是一种由约80个氨基酸组成的保守结构,包含三对二硫键,是行使生物学功能的独立折叠单元.现已证实,Kringle结构域存在于包括生长因子、蛋白酶和凝血因子等多种不同功能的蛋白质,如纤溶酶原中.Kringle结构域被认为是首个特异性抑制血管生长的保守结构的组成部分,许多Kringle结构域能够抑制血管新生,如纤溶酶原:Kringle 5. 脂蛋白(lipoprotein)是血浆中的脂质与特殊蛋白质结合的球状巨分子复合物,脂蛋白中的蛋白质即载脂蛋白(apolipoprotein).脂蛋白(a)[Lipoprotein(a),Lp(a)],含有载脂蛋白B100(ApoBlOO)和载脂蛋白(a)[Apo(a)]两类载脂蛋白.在包含Kringle结构域的蛋白质中,载脂蛋白(a)(apolipoprotein(a),apo(a))包含几个随机重复的与纤溶酶原Kringle 4类似的Kringle区域(Kringle Ⅳ),后面带有一个与纤溶酶原Kringle 5同源的Kringle Ⅴ结构域以及蛋白酶区域.已有一些研究揭示,apo(a)的这些结构也有类似于纤溶酶原相关Kringle结构域的抗新生血管活性,但apo(a)发挥抗血管新生活性的关键区域尚未得到清楚的阐明.因此,确定各结构域的抗血管新生活性位点及其潜在机制,对于更深入地认识包含多Kringle结构的血管生成抑制剂的功能具有重要意义. 出于此目的,我们选择apo(a)中与纤溶酶原K5唯一同源的KV结构域,应用生物信息学手段分析预测其氨基酸序列的结构和生物学特性,筛选出其中的一个11肽片段YTMNPRKLFDY,人工合成后观察其对VEGF诱导的小鼠角膜新生血管的作用,初步探讨apo(a)抗新生血管活性区域所在,并为进一步开发治疗眼部新生血管疾病的分子药物奠定基础. 第一部分生物信息学分析筛选小肽 目的:利用生物信息学的方法,对apo(a)KV的氨基酸序列进行分析,预测其抗新生血管的活性氨基酸位点所在. 方法:登陆美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)网站主页(http://www.ncbi.nlm.nih.zov/),进入NCBI默认的蛋白质数据库NRDB蛋白质序列复合数据库,查询

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