猪H-FABP基因多态性及其与肌内脂肪含量的遗传相关性研究

摘要

该研究以肌内脂肪含量较高的中国地方猪种大河猪、大乌猪和雅南猪及三元杂交猪(DLY)为试验动物,利用PCR-RFLPs技术研究了心脏型脂肪酸结合蛋白基因(Heart Fatty Acid-binding Protein gene,H-FABP)5'-上游区和第二内含子的遗传变异,分析了H-FABP基因不同位点各基因型对肌内脂肪含量的影响.利用PCR-RFLPs技术对H-FABP基因的多态性、基因频率和基因型频率的研究显示:在HinfⅠ-RFLP位点,四个猪种都存在变异,等位基因H的频率分别为0.8000、0.5000、0.4040和0.9650;在Hinf<'*>Ⅰ-RFLP位点,除DLY存在变异外,其余三个猪种只存在bb基因型,等位基因B在DLY中的频率是0.1960;在Msp Ⅰ-RFLP位点,四个猪种都存在变异,等位基因A的频率分别是0.8000、0.2500、0.9430和0.7960;在HaeⅢ-RFLP位点,雅南猪只存在DD基因型,其余三个猪种中都存在多态性,等位基因D的频率在大河猪、大乌猪和DLY猪中分别是0.9500、0.5000和0.1830.在HinfⅠ-RFLP位点,除DLY猪为低度多态(PIC<0.25)外,其余三个猪种为中度多态(0.25Ⅰ-RFLP位点,DLY猪为低度多态(PIC<0.25),其余三个猪种在该位点没有多态性,PIC=0;在Msp Ⅰ-RFLP位点,大河猪和大乌猪为中度多态(0.25Ⅰ-RFLP位点存在bb高于BB,BB高于Bb的规律;bb和BB两种基因型的肌内脂肪含量之间差异不显著(P>0.05).通过最小二乘分析发现,H-FABP基因的单倍体hh/bb/AA/DD(HinfⅠ-hh,Hinf<'*>Ⅰ-bb,Msp Ⅰ-AA,HaeⅢ-DD)具有最高的IMF均值(5.7157±2.9225),与IMF含量的最小二乘均值最大(7.7504),与IMF的效应值最高,是最佳基因型组合.

目录

摘要

1.前言

1.1猪肉质性状的研究

1.2猪肉质性状的分子标记

1.3影响猪肌内脂肪含量的候选基因的研究进展

1.4 FABPs家族的研究进展

1.5 H-FABP基因的研究进展

1.5.1 H-FABP基因的分子结构

1.5.2 H-FABP基因的定位

1.5.3 H-FABP基因的遗传变异

1.5.5 H-FABP与其他性状的相关性研究

1.6本研究提出的目的、意义

2.材料与方法

2.1试验材料

2.1.1试验动物

2.1.2主要仪器设备

2.1.3主要试剂及配制

2.1.4引物的筛选

2.2试验方法

2.2.1样品采集和保存

2.2.2基因组DNA抽提

2.2.3 DNA浓度和纯度检验

2.2.4 PCR反应

2.2.5 PCR-RFLP

2.2.6数据处理

3.结果分析

3.1基因组DNA抽提结果

3.2 H-FABP基因PCR产物的扩增结果

3.3 H-FABP基因的酸切结果

3.4各品种猪肌内脂肪含量比较

3.5各品种猪的H-FABP基因的基因型频率和基因频率分析

3.6不同品种猪H-FABP基因的遗传特性分析

3.7 H-FABP基因与肌内脂肪含量性状的相关性分析

3.7.1 H-FABP基因与各品种(系)猪IMF含量的相关性分析

3.7.2总群体中H-FABP基因不同位点各基因型对肌内脂肪含量的影响

4.讨论

4.1 PCR扩增

4.1.1模板DNA的质量

4.1.2引物的设计

4.1.3 PCR反应条件

4.1.4对PCR过程中主要疑难问题的解答

4.2 H-FABP基因各位点在不同品种(系)中的分布

4.3 H-FABP基因与不同品种(系)IMF的关系

4.4 H-FABP基因各位点与总群体猪IMF的关系

5.结论

参考文献

致谢