中国荷斯坦牛和黄改奶牛CSN1S2基因多态性与产奶性状之间的关系研究

摘要

本试验以中国荷斯坦牛和黄改奶牛为研究对象，采用PCR-SSCP分子标记方法对CSN1S2基因的多态性进行了分析，并结合测序对其基因的5’端、第2外显子和第3、4、5外显子进行了序列分析，旨在探索CSN1S2基因对奶牛生产性状的影响，为今后高良种奶牛的选育提供一定的理论依据。研究结果如下： 1.CSN1S2基因5’端多态性及序列分析 在中国荷斯坦牛和黄改奶牛5’端的引物CSN1S2P1扩增片段均检测到AA、BB、CC、AB、AC和BC6种基因型，群体多态信息含量(PIC)达到了中度多态(0.5＞PIC＞0.25)，群体中多态性高，遗传变异较大。测序结果显示，AA基因型个体在第2370bp处发生了G到A的碱基突变；BB基因型变异位点最多：在第2187bp处T碱基突变为G碱基，第2423bp处T碱基突变为C碱基，第2505bp处C碱基突变为A碱基，第2532bp、2533bp处C和T碱基突变为T和G碱基；CC基因型个体在2370bp处G碱基突变为A碱基，第2405bp处C碱基突变为A碱基，第2525bp处插入一个G碱基。 2.CSN1S2基因第2外显子多态性及序列分析 在中国荷斯坦牛和黄改奶牛第2外显子的引物CSN1S2P2扩增片段检测到AA、BB、AB3种基因型。具有多态性DNA序列在CSN1S2基因第二外显子所扩增的片段中AA基因型和BB基因型中国荷斯坦牛和黄改奶牛个体均在第4129bp处发生了碱基突变，T碱基突变成了G碱基，BB基因型个体在第4263bp处插入了一个G碱基，第4346bp处碱基T突变成了碱基C；BB基因型个体在第4263bp处的突变位于编码区，发生的突变是同义突变，未造成氨基酸的变化。 3.CSN1S2基因第4、5外显子多态性及序列分析 第4、5外显子的引物CSN1S2P3扩增片段在中国荷斯坦牛检测到AA、BB、AB三种基因型，在黄改奶牛上只检测到AA和AB两种基因型，没有检测到BB基因型。在CSN1S2基因引物CSN1S2P3所扩增的片段中AA基因型个体在第6892bp处T碱基突变成为C碱基，6920bp处A碱基突变为G碱基，7174bp处插入一个C碱基；BB基因型仅在第6920bp处A碱基突变为G碱基。 4.CSN1S2基因第3外显子多态性 第3外显子的引物CSN1S2P4扩增片段在中国荷斯坦牛中表现出多态性，但是只检测出一个BB基因型个体，其余全部是AA基因型个体，没有检测出AB基因型个体；在黄改奶牛中只检测出AA基因型个体，没有检测出AB基因型和BB基因型个体。 5.CSN1S2基因多态性与产奶性状之间的关系 本试验将CSN1S2基因作为中国荷斯坦牛和黄改奶牛产奶性状的候选基因进行研究，研究发现在CSN1S2P1扩增片段中，中国荷斯坦牛BC基因型个体产奶量表现最好；在CSN1S2P2扩增片段中，中国荷斯坦牛AA基因型个体的乳蛋白率表现最好，适合作为中国荷斯坦牛的标记辅助选择位点。在CSN1S2P2扩增片段中黄改奶牛AA基因型个体的乳脂率和乳蛋白率显著高于BB和AB基因型个体，AA基因型个体产奶量也高于其他两种基因型，适合作为黄改奶牛的标记辅助选择位点。

目录

文摘

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第一部分文献综述

1乳蛋白基因多态性及其与泌乳性状关系的研究概况

1.1乳蛋白及其作用

1.2乳蛋白基因的定位和结构

1.3乳蛋白基因多态性及其与泌乳性状之间的关系

2分子标记方法概述

2.1数量性状基因的标记方法

2.2遗传标记在家畜育种中的应用

3影响奶牛泌乳性状的其它候选基因

3.1 Weaver基因

3.2生长激素和生长激素受体基因

3.3肥胖基因

3.4催乳素基因

3.5牛白细胞抗原基因

3.6胰岛素样生长因子

3.7垂体特异转录因子基因

3.8二脂酰甘油甲基化转移酶-1基因

3.9核外基因

第二部分试验研究

第一章材料与方法

1.1试验材料

1.2主要仪器设备及试剂、溶液的配制

1.3试验方法

1.4统计分析

第二章结果与分析

2.1奶牛血液基因组DNA的电泳检测

2.2 CSN1S2基因引物CSN1S2 P1 的PCR-SSCP标记

2.3 CSN1S2基因引物CSN1S2P2扩增产物的PCR-SSCP标记

2.4 CSN1S2基因引物CSN1S2 P3 扩增片段的PCR-SSCP标记

2.5 CSN1S2基因引物CSN1S2 P4 的PCR-SSCP标记

2.6 CSN1S2基因引物CSN1S2 P5 PCR-SSCP分子标记

2.7 CSN1S2基因引物CSN1S2 P6 PCR-SSCP分子标记

第三章讨论与结论

3.1讨论

3.2结论

参考文献

附录

致谢

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