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河南华溪蟹生殖调控基因vasa的克隆和原核表达

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摘要

vasa基因编码一种ATP依赖的RNA解旋酶,属于DEAD-box家族,最先在果蝇(Drosophila)中被发现。vasa基因在生殖细胞中特异表达,在动物生殖细胞发生和生殖调控中发挥着重要作用,被用作生殖细胞的分子标记物,主要用于配子发生和原生殖细胞(PGCs)的起源、迁移和分化等方面的研究。
  本文通过RACE技术克隆得到了河南华溪蟹(Sinopotamon henanense)vasa基因cDNA序列,证实了vasa基因仅在生殖细胞中特异表达;构建了河南华溪蟹VASA蛋白原核表达载体Vexp-28a、Vexp-32a、Ve-28a及Ve-32a,并在大肠杆菌BL21(DE3)中进行了原核表达。
  本文克隆得到的河南华溪蟹 vasa基因 cDNA序列长2896bp,其中编码区长1329bp,编码442个氨基酸的蛋白。Blast比对结果表明由该 cDNA序列推测翻译的蛋白氨基酸序列与鱼类、两栖类、鸟类、哺乳类以及一些无脊椎动物的 VASA蛋白氨基酸序列有较高的相似性;结构域分析也表明该氨基酸序列具有 DEAD-box家族共有的4个保守motif(motif I、motif Ia、motif Ib、motif II)、一个锌指结构和GG重复序列,还具有 VASA亚家族基因专一性特征结构,如 Q-motif、RGG重复序列和甘氨酸富集区,与DEAD-box家族蛋白具有的8个保守结构域motif I、motif Ia、motif Ib、motif II、motif III、motif IV、motif V、motif VI以及两个锌指结构、一个Q-motif、GG重复的结构相比,本文获得的蛋白氨基酸序列在motif II之前(包括motif II)的序列是正确的,但在motif II之后的序列中,由于一些原因使蛋白翻译提前终止,因此,我们所得到的Sh-vasa基因cDNA序列的3’端还待进一步验证;多序列比对和系统进化分析显示该cDNA序列编码的氨基酸序列与其它虾蟹类的VASA蛋白进化关系最近。以上结果均表明,本文所获得的cDNA序列确定为河南华溪蟹vasa基因5’端及部分编码区cDNA序列。通过半定量PCR(Sq-PCR)监测河南华溪蟹vasa基因在不同组织中的表达情况,结果显示,vasa基因在河南华溪蟹体内仅在生殖细胞中特异表达。
  以得到的河南华溪蟹vasa基因cDNA序列为基础,设计两对引物,通过PCR,在选定的vasa基因片段两端加上EcoR I和Xho I酶切位点,然后利用基因重組技术将获得的vasa基因表达片段分别克隆至pET-28a、pET-32a原核表达载体,经酶切鉴定和测序,成功构建河南华溪蟹VASA蛋白原核表达载体Vexp-28a、Vexp-32a、Ve-28a及Ve-32a,并通过IPTG诱导进行原核表达,蛋白上清和包涵体沉淀分别经过His?Tag 亲和层析柱分离、纯化,通过SDS-PAGE分析以及Western blot鉴定,所得蛋白并非河南华溪蟹VASA融合蛋白,需在河南华溪蟹vasa基因cDNA序列内重新选取表达片段,或重新选择表达载体,改进实验方案,再次实验,以期获得河南华溪蟹VASA融合蛋白。

著录项

  • 作者

    李怡婷;

  • 作者单位

    山西大学;

  • 授予单位 山西大学;
  • 学科 水生生物学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 王兰,孙敏;
  • 年度 2016
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类 Q959.223.63;
  • 关键词

    河南华溪蟹; 原核表达; 蛋白纯化; 基因编码;

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