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通辽地区食管癌相关microRNA及其在食管癌发生中的可能作用

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摘要

1.引言

1.1 Mi croRNA概述

1.1.1 MicroRNA定义、发现和功能

1.2 MicroRNA与疾病

1.2.1 癌症

1.2.2 miRNA在食管癌中的作用

2.材料与方法

2.1 样品采集

2.2 实验设备及方法

2.2.1 主要仪器

2.2.2 主要试剂及材料

2.2.3 其他常用试剂

2.2.4 提取步骤

2.2.5 Total RNA质量检测

2.2.5 总RNA质量检测结果

3.结果及讨论

3.1 各组组织丰度和长度分布

3.2 不同类别RNA分布

3.3 miRNA散点图比对

3.4 组间差异mi-RNA

3.5 采用热图对差异表达miRNA进行聚类分析

4.结论

5.展望

参考文献

文献综述

致谢

作者简历

声明

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摘要

目的:研究分析通辽地区食管癌患者癌组织、癌旁组织及正常食管黏膜组织中microRNA的表达,找出其差异性microRNA,探索该地区食管癌患者发病的相关microRNA及其可能作用。
  方法:收集2014年01月~2014年12月于内蒙古民族大学附属医院、通辽市医院、科区医院行食管癌根治术患者的新鲜食管癌组织、癌旁组织及正常食管黏膜组织使用液氮转运至-80℃冰箱保存备用。从中选取符合入组标准的6名患者、18个组织标本。通过二代测序技术检测microRNA表达谱、找出其具有差异性表达的microRNA,进一步分析其在食管癌发生中的可能作用。
  结果:通过检测microRNA表达谱,利用参数FDR≤0.1%,差异倍数2倍以上筛选,共发现了9个发生显著差异表达的miRNAs。同正常食管黏膜组织相对比,食管癌组织的miR-215-5p、miR-196a-5p、miR-215-3p、miR-3660及miR-7-5p microRNA表达上调;与癌旁组织相比较,食管癌组织的miR-215-5p、miR-215-3p上调及miR-1269b下调;对比正常组织,食管癌旁组织中,miR-165-3p、miR-196a-5p、miR-1269a及miR-1269b上调,miR-490-3p下调。虽然各组间有显著差别表达mi-RNA,但是由正常组织到癌旁组织,再到食管癌组织,三组间未见有同时存在的显著筹异表达mi-RNA。
  结论:通辽地区食管癌患者,癌组织与正常食管粘膜组织对比,miR-215-5p、miR-196a-5p、miR-215-3p、miR-3660、miR-7-5p表达上调在食管癌发生中可能起重要作用;癌组织与癌旁组织对比miR-215-5 p、miR-215-3p上调及miR-1269b下调,可能与食管癌浸润性生长相关;癌旁组织与正常组织对比,miR-165-3p、miR-196a-5p、miR-1269a及miR-1269b上调,miR-490-3p下调可能存食管癌早期发病中发挥作用。

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