花生栽培种遗传多样性的SSR分析及其指纹图谱的构建

摘要

花生是重要的油料作物和经济作物。中国拥有较为丰富的种质资源,但是随着针对性育种工作的广泛进行,花生栽培种遗传背景越来越狭窄。遗传多样性研究是进行花生栽培种育种改良的基础,而品种的指纹图谱鉴定可为育种工作的知识产权保护提供科学依据。本文以筛选出的100对SSR引物分析144份花生栽培种的遗传多样性,并对银染和荧光检测技术两种SSR PCR扩增产物的检测方法进行对比,同时选取23对引物的159个标记构建群体的指纹图谱,进而为育种提供分子依据、为生产提供服务。主要研究结果如下:
　　1.144份花生栽培种的遗传多样性分析:应用100对SSR引物对144个花生栽培种进行PCR扩增,共检测到409个等位变异,每对SSR引物平均能够检测到4.09个等位变异;聚类分析结果表明,100对SSR引物能够将供试的所有品种区分开,聚类结果与栽培花生类型、产地及亲缘关系呈正相关;品种遗传相似系数为0.68-0.97。可见,总体上栽培花生遗传基础较为狭窄,特别是国内现有的育成品种。多样性分析显示,地方品种和国外品种与其他品种间遗传距离较大,作为亲本应用于育种可拓宽选育品种的遗传背景。
　　2.银染和荧光检测技术的对比:选取9对多态性及特异性较好的引物,分别用银染法和荧光检测法扫描了85个栽培品种的SSR标记多态性。与银染法相比,荧光检测法具有灵敏度高、准确性强、效率高、在遗传多样性分析方面更精确可靠等优点。此外,通过高通量PCR、高通量上样检测及大片段检测优化等方法可以提高荧光检测法检测效率,有效降低实验成本。
　　3.144份花生栽培种SSR指纹图谱的构建:应用23对等位变异数目大于5的SSR引物构建了144个供试材料的指纹图谱,以0、1形式统计,并将0、1字符串转换为十六进制,结果表明每一个品种的指纹图谱均为唯一代码。下一步将通过F1群体或亲缘关系较近的品种对构建的指纹图谱进行验证,以期为花生育种提供科学准确的鉴定手段。

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第一章 文献综述

1.1花生栽培种概述

1.2 SSR分子标记

1.3 SSR标记检测技术

1.4 SSR标记在作物种质资源鉴定中的应用

1.5 SSR标记在我国花生育种研究中的应用

1.6 本项研究的目的与意义

第二章 材料与方法

2.1供试材料

2.2 实验器材与药品

2.3 实验方法

第三章 结果与分析

3.1 SSR引物筛选

3.2 144份花生材料的SSR电泳检测

3.3 144份栽培花生的遗传多样性分析

3.4荧光检测法与银染法的比较

3.5花生栽培种指纹图谱的构建

第四章 讨论

4.1基于SSR标记的花生栽培种遗传多样性分析

4.2 荧光检测法与银染法的比较

4.3 大样本指纹图谱的构建

参考文献

附表

在校期间发表的学术论文

致谢