PTK2B基因rs28834970与迟发型阿尔茨海默病相关性研究：病例-对照研究与荟萃分析

摘要

背景：最近一项大型的全基因组关联性研究的荟萃分析证实了酪氨酸蛋白激酶（Protein tyrosine kinases2 beta，PTK2B）基因可增加高加索人群中阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease, AD）的发病风险。考虑到种族异质性，我们旨在探讨中国北方汉族人群中 PTK2B基因多态性与迟发型阿尔茨海默病（late-onset Alzheimer’s disease，LOAD）发病风险的相关性。
　　方法：采用病例-对照研究方法，选取984例散发的LOAD患者作为病例组，1354例年龄、性别相匹配的健康人群作为对照组，研究对象均为北方汉族人群。我们使用全血DNA提取试剂盒提取外周血白细胞的DNA，采用多重荧光PCR技术对PTK2B基因 rs28834970位点进行基因分型，运用聚合酶链式—连接酶检测反应技术（PCR-LCR）进行载脂蛋白（apolipoprotein E，APOE）基因（rs429358和rs7412）分型。应用卡方检验研究 PTK2B基因 rs28834970位点的基因型和等位基因频率与LOAD的相关性。同时将年龄、性别、APOEε4携带状态作为协变量后，采用Logistic回归方法研究PTK2B基因多态性rs28834970与LOAD的相关性。同时，为了尽量减少样本量、种族差异等因素对试验结果所带来的偏倚，我们对1968年8月至2017年2月期间收录于PubMed数据库中所有相关文献进行了系统检索，纳入的研究类型为病例对照研究。结合本次实验数据，采用固定效应模型及逆方差加权法对基因的叠加模型进行分析来探讨PTK2B基因多态性rs28834970与LOAD的相关性。随后，为了探讨APOE基因在北方汉族人群中对PTK2B基因多态性与LOAD相关性的影响情况，我们先是采用条件性Logistic回归方法进行了PTK2B基因与APOE基因之间的交互作用与LOAD发病率之间关系的分析，此时，我们将年龄、性别纳入作为协变量。随后，我们又根据 APOEε4携带情况将研究对象进行分层，应用卡方检验研究PTK2B基因rs28834970位点的基因型和等位基因频率与LOAD的相关性。同时将年龄、性别作为协变量后，采用 Logistic回归方法研究 PTK2B基因多态性rs28834970与LOAD的相关性，以此来更加深入地分析APOE基因对PTK2B基因多态性与LOAD相关性的影响。
　　结果：我们共招募了984例散发的LOAD患者及年龄、性别与之相匹配的健康对照人群。与对照组相比，病例组的简易精神状态量表(Mini-Mental State Examination score，MMSE)的评分偏低（P〈0.01），且 APOEε4等位基因频率偏高（P〈0.01）。在总体样本中，尽管病例组中 rs28834970的最小等位基因 C的频率比对照组高（26.52%vs.24.74%），但 PTK2B基因多态性 rs28834970位点的基因型和等位基因频率与LOAD的相关性无统计学意义（P＞0.05）。并且，应用三种遗传模型的条件性Logistic回归也并未发现rs28834970与LOAD的相关性（显性模型, OR=1.148,95%CI=0.970–1.359, P=0.108;隐性模型, OR=1.151,95%CI=0.833–1.590, P=0.394;叠加模型, OR=1.117,95%CI=0.977–1.276, P=0.105）。然而，82513例样本量的荟萃分析结果显示PTK2B基因的rs28834970可以提高LOAD的发病风险(OR=1.09,95%CI=1.07–1.12)。此外，在携带APOEε4的研究对象中，rs28834970的等位基因频率在病例组与对照组之间存在差异（P=0.027, OR=1.423,95%CI=1.041–1.945）。同时，将年龄、性别作为协变量后的Logistic回归分析结果显示，在叠加模型中rs28834970位点与LOAD存在关联性（P=0.041, OR=1.384,95%CI=1.014–1.891)。
　　结论：PTK2B基因多态性rs28834970可以提高LOAD易感性，在中国北方汉族人群中，PTK2B可能是与APOE基因相互作用进而增加LOAD的发病风险。未来的研究应采用神经影像学和脑脊液中标记物对 AD的起病和发展进程进行分级，同时，也需纳入更多的突变位点，功能性遗传分析用以阐明相关位点潜在发病机制，这可能会为AD治疗提供新的靶点。

目录

引言

研究对象与方法

1.1 研究对象

1.1.1 研究对象来源

1.1.2 病例组的入选和排除标准

1.1.3 对照组的入选和排除标准

1.2 仪器、材料与实验试剂

1.2.1 主要仪器PCR反应仪

1.2.2 主要试剂

1.3 实验方法

1.3.1 标本采集

1.3.2 DNA提取

1.3.3 DNA质量检测

1.3.4 DNA浓度、纯度测定及分装

1.3.5 PTK2B基因及APOE基因分型

1.4 统计分析

1.5 荟萃分析

1.5.1 文献选择过程及纳入标准

1.5.2 数据的提取

1.5.3统计分析

结果

2.1 研究对象的一般特征

2.2APOE基因多态性的频率分布

2.3PTK2B基因的rs28834970基因型和等位基因频率分布

2.4PTK2B基因多态性与LOAD相关性的多因素Logistic回归分析

2.5PTK2B基因与APOE基因相互作用与LOAD相关性分析

2.6 PTK2B基因位点rs28834970与AD易感性研究的Meta分析

讨论

结论

参考文献

综述:PTK2B的基因多态性与迟发性阿尔茨海默病的相关性研究

攻读学位期间的研究成果

附录

致谢

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