新品系绒山羊育种研究现状与微卫星DNA标记辅助选择的研究

摘要

本研究利用14个微卫星位点标记检验了120只辽宁新品系绒山羊种内的等位基因组成，计算了14个微卫星座位的等位基因数，等位基因频率、多态信息含量(PIC)及平均杂合度，结果表明14个微卫星座位的平均等位基因数为4.786个、平均杂合度为0.9407、平均多态信息含量为0.6803。对其进行群体遗传学特性分析，并利用SPSS程序下的Duncan，LSD分析和多重比较发现体重、绒产量和绒细度3个经济性状与标记基因型的关系。 (1)利用POPGENE软件对新品系绒山羊第10号、第11号和第12号染色体上14个微卫星位点的多态性进行了检测，结果表明：McM185有5个等位基因，8种基因型，ILSTS005有5个等位基因，11种基因型，INRA071有3个等位基因，4种基因型，TGLA272有4个等位基因，9种基因型，BMS2569有6个等位基因，9种基因，RM096有6个等位基因，9种基因型，LSCV44有5个等位基因，10种基因型，ILSTS045有5个等位基因，10种基因型，BMS2252有6个等位基因，9种基因型，BMS0712有4个等位基因，7种基因型，BM6404有4个等位基因，8种基因型，INRA005有4个等位基因，4种基因型，ILSTS033有5个等位基因，9种基因型。本实验的14个位点都是高度多态(PIC>0.5)。 (2)利用14微卫星引物分析辽宁新品系绒山羊的经济性能(体重性状，绒产量性状，绒细度性状)。结果表明：在体重性状上，McM185引物的AD型，INRA071引物的BB型，TGLA272引物的CC型，RM096引物的BF型，ILSTS045引物的CE型，BMS2252引物的BD型，BM6404引物的BD型的基因型值皆大于同位点其他基因型的值，并且差异显著(p<0.05)，其中INRA071引物的BC型，RM096引物的BE型差异极显著(p<0.01)皆体重性状标记的优势条带。在绒产量性状上TGLA272引物的DD型，LSCV44引物的BE型，ILSTS045引物的AD型，BMS2252引物的CE型，的基因型值皆大于同位点其他基因型的值，并且差异显著(p<0.05)，其中，ILSTS005引物的CO型，BM0712引物的BD型，BM6404引物的CD型，ILSTS033引物的CE型差异极显著(p<0.01)皆为绒产量性状标记的优势条带。在绒细度性状上，BMS2569引物的AB型，BMS2252引物的EF型，ILSTS033引物的AA型的基因型值皆大于同位点其他基因型的值，并且差异显著(p<0.05)，其中，LSCV55引物的BD型，RM096引物的CE型，LSCV44引物的AD型，ILSTS045引物的AB型差异极显著(p<0.01)皆为绒细度性状标记的优势条带。

目录

文摘

英文文摘

声明

第一章新品系绒山羊育种研究现状及文献综述

1.1绒山羊的育种现状

1.2今后研究方阳及展望

1.3分子标记与辽宁新品系绒山羊遗传育种

1.4分子标记的发展简介

1.4.1以分子杂交为基础的Ⅰ类分子标记

1.4.2以PCR为基础的Ⅱ类分子标记

1.4.3以测序为核心的Ⅲ类分子标记及其他标记

1.4.4几种常用的分子遗传标记的原理及特点

1.5微卫星DNA标记

1.5.1微卫星标记的发现

1.5.2微卫星DNA的结构

1.5.3 微卫星的遗传特点

1.5.4 微卫星的多态性机理

1.5.5微卫星DNA功能

1.5.6 微卫星标记与生产性状的结合

1.5.7 微卫星DNA在羊遗传育种中的应用

1.6数量性状位点

1.7标记辅助选择(MAS)

1.8本研究的目的意义

第二章新品系绒山羊微卫星位点多态性及其与经济性状相关分析

2.1实验材料

2.1.1样本的采集

2.1.2微卫星引物

2.1.3试剂及仪器

2.2实验方法

2.2.1基因组DNA的提取

2.2.2 DNA浓度和纯度的检测

2.2.3设计引物

2.2.4 PCR扩增

2.2.5 PCR扩增产物的凝胶电泳

2.2.6聚丙烯酰胺凝胶的银染(以下操作均在摇床上进行)

2.2.7微卫星基因型的判定

2.3统计分析

2.3.1等位基因频率(Allele frequence)

2.3.2多态信息含量(Polymorphism Information Contert,PIC)

2.3.3群体杂合度(Heterozygosity,H)

2.3.4有效等位基因数(Effective numbers of alleles,Ne)

2.3.5与经济性状结合进行统计分析

2.4结果与分析

2.4.1基因组DNA的检测

2.4.2微卫星位点的检测

2.4.3 14个微卫星位点的研究结果

第三章讨论

参考文献

致谢