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TM6SF2 rs58542926、PNPLA3 rs738409基因多态性与慢性乙型肝炎的相关性

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目录

声明

摘要

前言

1.研究对象

2.主要试验仪器设备和试剂

2.1 主要试验仪器设备

2.2 主要试验试剂

4.2 指标测量

5.诊断标准及排除标准

6.基因组DNA的提取和基因分型

6.1 基因组DNA的提取

6.2 TM6SF2 rs58542926、PNPLA3 rs738409基因多态性检测

7.统计学方法

7.4 PNLA3 rs738409、TM6SF2 rs58542926基因多态性与脂质、病毒载量的相关性分析

结果

5.PNPLA3 rs738409(C>G)基因多态性与脂质、病毒载量的相关性

6.TM6SF2 rs58542926(C>T)基因多态性与脂质、病毒载量的相关性

附表

讨论

结论

参考文献

综述 TM6SF2 rs58542926、PNPLA3 rs738409基因多态性与肝脏相关疾病相关性

攻读学位期间发表文章情况

致谢

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摘要

慢性乙型肝炎(Chronic hepatitis B,CHB)是由损害肝脏的乙型肝炎病毒(hepatitis BVirus,HBV)慢性感染引起的疾病,每年因HBV感染引起的并发症如肝衰竭、肝硬化、肝癌等而死亡的患者高达65万人。GWAS研究表明基因的遗传突变与HBV感染密切相关。PNPLA3I148M单核苷酸多态性影响其蛋白表达,使脂肪酰基水解酶活性受到限制,从而使肝脏脂肪含量增加。TM6SF2基因rs58542926(C>T)单核苷酸多态性导致其编码蛋白的167位氨基酸由谷氨酸突变为赖氨酸,降低了TM6SF2蛋白稳定性,导致肝脏脂蛋白合成增加以及脂质转运减少。TM6SF2rs58542926、PNPLA3rs738409基因多态性与脂质代谢关系密切,而HBV能限制牛黄胆酸共转运多肽的功能,从而促进胆汁酸和胆固醇的合成,脂质代谢水平异常存在于HBV病毒感染复制的整个过程。
  目的:本研究旨在探讨中国汉族人群TM6SF2rs58542926、PNPLA3rs738409基因多态性与CHB的相关性。
  方法:本项研究为病例一对照试验,选取时间从2016年10月至2017年11月就诊于青岛市市立医院消化内科病房、青岛市传染病院、消化内科及肝病内科门诊患者416人,其中260人(男性160例,女性100例)为病例组,156人(男性86名,女性70名)为对照组。收集所有受试者的一般临床资料(如性别、年龄、既往病史、抗病毒治疗病史等)和各项临床指标(ALT、AST、GGT、LDL等),根据所收集数据中的计量资料采用均数±标准差((x)±s)表示,计数资料、计量资料分别用x2检验、t检验,同时运用非条件逻辑回归模型评估各基因位点突变与罹患CHB疾病的风险,结果以OR及95%CI表示。分析比较260例CHB患者和156名健康对照组的血液标本,运用荧光定量(PCR)技术,并统计各组基因型。研究TM6SF2rs58542926、PNPLA3rs738409各等位基因分布特点及其基因多态性与罹患CHB的风险的相关性,同时探讨TM6SF2rs58542926、PNPLA3rs738409基因多态性与脂质、病毒载量的相关性。采用SPSS20.0对数据进行分析。
  结果:TM6SF2rs58542926、PNPLA3rs738409基因多态性运用Hardy-Weinberg遗传平衡定律检验,对照组和CHB组中各等位基因及基因型均符合机体基因遗传平衡(P>0.05),具有群体代表性。CHB组中PNPLA3rs738409等位基因C、G所占百分比分别为68.1%、31.9%,而对照组中等位基因C、G所占百分比分别为78.5%、21.5%。CHB组与对照组相比,PNPLA3rs738409位点各等位基因及基因型分布具有明显统计学差异(P<0.05)。GC+GG基因型携带者与CC基因型携带者相比较,前者发生CHB的OR=1.870(95%CI为1.244~2.811),P<0.05。TM6SF2rs58542926对照组中C等位基因296(94.9%)、T等位基因16(5.1%),而CHB组中C等位基因488(93.8%)、T等位基因32(6.2%)。其等位基因及各基因型分布在CHB组和对照组中并无明显差异,同时也无明显统计学意义(P>0.05)。CT+TT基因型携带者与CC基因携带者相比较,前者患CHB的OR=0.844(95%CI为0.446~1.599),而T等位基因与C等位基因携带者相比较,其发生CHB风险OR=1.213(95%CI为0.654~2.249),不具有统计学意义(P>0.05)。在CHB组中,PNPLA3rs738409含G等位基因患者具有更高的血清HDL水平,具有统计学意义(P<0.05),而TM6SF2rs58542926携带T等位基因患者其血清LDL水平更低,差异具有统计学意义(P<0.05)。CHB组中,PNPLA3rs738409、TM6SF2rs58542926基因突变与HBV-DNA水平未见明显差异,同时也无明显统计学意义(P>0.05)。
  结论:PNPLA3rs738409含G等位基因携带者增加了罹患CHB的风险;TM6SF2rs58542926基因多态性与罹患CHB的风险无相关性。在CHB组中,PNPLA3rs738409G等位基因携带者具有更高的血清HDL水平,而TM6SF2rs58542926T等位基因携带者其血清LDL水平更低。PNPLA3rs738409、TM6SF2rs58542926基因突变与HBV-DNA水平无相关性。

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