文摘
英文文摘
0前 言
1 DNA序列的特征序列
1.1背景及综述
1.1.1序列比对
1.1.2压缩矩阵的不变量方法
1.1.3其它的DNA序列的相似性比较方法
1.2 DNA序列的特征序列
1.3特征序列的压缩矩阵
1.4利用特征序列的压缩矩阵比较DNA序列
1.5特征序列的比较
1.6本章小结
2特征序列的应用:一个基因识别算法
2.1背景及综述
2.2基因识别算法
2.2.1酵母菌基因组数据库
2.2.2特征序列的数值刻划
2.2.3基因识别算法
2.3算法的评估及其应用
2.3.1灵敏度、专一性和正确度的定义
2.3.2算法的评估
2.4应用算法到酿酒酵母菌基因组的第2-6类
2.5本章小结
3蛋白质序列的数值刻划
3.1背景及综述
3.2蛋白质的特征序列及其数值刻划
3.3利用蛋白质的特征序列分析蛋白质二级结构
3.4本章小结
4特征序列与DNA的图形表示
4.1背景及综述
4.2 3维图表示的一些性质
4.3对称群S4作用在DNA-曲线和DNA矩阵上
4.4两个等价关系
4.5定理的证明
4.6特征序列与DNA图形表示的关系
5参考文献
6附录-分子生物学知识概论
6.1 DNA与RNA的组成与结构
6.2蛋白质的结构
6.3中心定理和遗传密码
7索引
读博期间发表、完成论文及获奖情况
创新点摘要
致谢