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第一章文献综述
1动物遗传多样性研究的意义、内容和方法
1.1动物遗传多样性的涵义
1.2国内外动物遗传多样性概况
1.3动物遗传多样性保护的意义
1.4动物遗传多样性评价的内容
1.5动物遗传多样性的研究方法
1.6动物遗传多样性评价指标
2微卫星标记与遗传多样性研究
2.1微卫星标记概述
2.2微卫星的类型
2.3微卫星在基因组中的作用
2.4微卫星突变
2.5微卫星标记的优点
2.6微卫星标记的局限性
2.7微卫星标记在群体遗传多样性研究中的应用
3线粒体DNA(mitochondrial DNA, mtDNA)标记与遗传多样性研究
3.1动物线粒体DNA的结构
3.2动物线粒体基因组的遗传特征
3.3动物mtDNA的多态性
3.4动物mtDNA的异质性
3.5 mtDNA多态性的研究方法
3.6对mtDNA各片段的研究
3.7动物mtDNA标记在群体遗传多样性研究中的应用
4中国地方鸡品种的起源及演化
4.1考古学研究
4.2历史记录
4.3形态学特征
4.4生化及分子生物学研究
5本研究的目的与意义
第二章中国家鸡和红色原鸡微卫星DNA遗传多样性及亲缘关系分析
1材料与方法
1.1试验材料
1.2试验方法
1.3统计方法
1.4统计分析(软件应用)
2结果与分析
2.1 DNA提取结果和PCR扩增产物检测
2.2引物组合及多重PCR反应条件的优化
2.3多重PCR电泳检测结果
2.4群体内的遗传变异
2.5群体间的遗传分化
2.6遗传距离与地理距离的相关性
2.7聚类分析
3讨论
3.1多重PCR及其产物的自动化检测
3.2群体内的遗传多样性
3.3群体间的遗传分化
3.4 15个中国鸡种间的遗传关系
3.5品种间遗传距离与地理距离的关联性
3.6红色原鸡与中国家鸡的亲缘关系
第三章样本量、性别和微卫星座位数对微卫星分析中群体遗传多样性指标的影响
1材料与方法
1.1试验材料
1.2群体遗传多样性指标的选择与统计分析
1.3遗传距离的估测精度统计尺度
2结果与分析
2.1样本量对期望杂合度的影响
2.2样本量对有效等位基因数的影响
2.3性别对群体遗传多样性指标的影响
2.4不等微卫星座位数目对遗传距离的影响
2.5 5个水平t检验结果
3讨论
3.1样本量对群体遗传多样性指标的影响
3.2微卫星分析群体遗传多样性时样本量的确定
3.3性别对群体遗传多样性指标的影响
3.4微卫星座位的数目对遗传距离的估测精度的影响
第四章近缘物种间微卫星引物的适用性分析——孔雀微卫星引物筛选及其遗传多样性分析
1材料与方法
1.1试验动物
1.2基因型测定
1.3统计方法
2结果与分析
2.1鸡微卫星引物在孔雀中的PCR扩增结果
2.2群体内的遗传变异
2.3群体间的遗传分化
3讨论
3.1近缘物种间微卫星引物的适用性
3.2绿孔雀和蓝孔雀群体内的遗传分析
3.3绿孔雀和蓝孔雀群体间的遗传分析
第五章中国家鸡和红色原鸡mtDNA遗传多样性及亲缘关系分析
1材料与方法
1.1试验材料
1.2试验方法
1.3统计方法及软件应用
2结果与分析
2.1 DNA提取结果和PCR扩增产物检测
2.2 16个鸡群mtDNA D-loop区部分序列的遗传多态性
2.3 16个鸡群体mtDNA D-loop区部分序列的遗传结构
2.4 mtDNA D-loop单倍型的分子系统树
2.5 16个鸡群体D-loop序列单倍型网络图
2.6 16个群体的分子系统树
3讨论
3.1 16个鸡群mtDNA D-loop区部分序列的遗传多态性
3.2 16个鸡群体内mtDNA D-loop遗传多样性
3.3 16个鸡群体间mtDNA D-loop遗传多样性
3.4地理距离与群体间mtDNA遗传距离的关系
3.5中国家鸡的起源探讨
全文结论
参考文献
致谢
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攻读学位期间已正式录用的学术论文目录
