VRTN和KTN1基因转座子插入多态鉴定及其与生产性能的关联分析

目录

摘要

第一章转座子概述

1转座子

1．1转座子的定义

1．2转座子分类

1．3转座子对基因组和基因进化的影响

1．4转座子技术的应用

1．5短散在重复序列(SINE)概述

1．6 VRTN基因研究进展

1．7 KTN1基因研究进展

第二章SINE-VRTN与生长繁殖性能的关联分析及生物信息学分析

1材料与方法

1．1试验动物

1．2主要仪器设备

1．3主要试剂

1．4基因组提取

1．5聚合酶链式反应——PCR及琼脂糖凝胶电泳检测

1．6引物设计及合成

1．7统计分析

1．8获取VRTN基因和侧翼序列

1．11基因结构和启动子预测

2结果

2．1通过比较基因组比对发现VRTN基因3个大的结构突变

2．2逆转录转座子注释从SINE插入多态发现VRTN基因3个大片段结构突变

2．3VRTN-sRTIPs在不同品种的不均匀分布

2．4 VRTN基因中SINE插入情况在群体中与生长繁殖性状关联分析

3讨论

4小结

第三章SINE-KTN1与生产性能的关联分析及生物信息学分析

1．6 KTN1序列(包括基因和侧翼区)在不同物种间保守性分析

1．7逆转录转座子注释

1．8启动子预测

1．9多序列比对

2结果

2．1 KTN1基因比较基因组比对

2．2 KTN1基因在不同物种中相对比较保守

2．3转座子对KTN1基因的贡献

2．4 KTN1基因中存在13个结构突变

2．5群体多态性检测

2．6KTN1基因中SINE插入情况在群体中与生长繁殖性状关联分析

3讨论

4小结

全文结论

本研究创新点

参考文献

致谢

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