KIR/HLA基因与HIV亚型对HIV感染及疾病进展影响的初步研究

摘要

研究背景与目的:不同个体对HIV的易感性及感染后病程的发展与预后存在很大的差异，国内外大量研究结果显示，从HIV感染发展到AIDS有数月至数年长短不一的潜伏期，其主要受病毒生物学特性、宿主的遗传特征和免疫应答的影响，宿主遗传特性中KIR/HLA基因及配受体对的作用值得关注。本文首先通过Meta分析，研究中国人群HLA-B基因与HIV易感性及疾病进程的关联性，进而确定可能的KIR/HLA配受体对。同时结合不同HIV亚型进行多因素分析，探讨HIV感染易感性和疾病进程快慢的影响因素，为进一步阐明HIV/AIDS患者感染及病程发展中相关因素的作用机制提供依据。
　　研究方法:1.采用循证医学获取最佳证据的系统评价方法，全面检索已发表的中国人群HLA-B基因多态性与HIV关联性的病例对照研究文献，同时追溯其参考文献，按纳入与排除标准进行文献筛选、资料提取及质量评价，使用Revman4.2及SAS9.1.3进行Meta分析。2.流行病学调查:以江苏省无锡市疾控中心确诊的HIV/AIDS人群、健康体检者为研究对象，在调查对象知情同意的基础上开展问卷调查（内容包括一般人口学特征、疾病信息、治疗信息等），并采集其静脉血。3.提取静脉血标本的核酸，采用PCR-SSP法检测KIR3DS1基因;PCR-SBT法进行HLA-B基因分型;巢式聚合酶链反应法扩增并测序，以进行HIV亚型的判定;流式细胞仪检测法检测CD4+T淋巴细胞数。4.多重横断面调查:获取研究对象的多次CD4+T细胞计数结果以进行病程进展情况分组。5.建立Excel数据库，使用SPSS19.0软件结合流调资料和实验结果进行分析，定性资料采用频数和百分比统计描述，x2检验统计分析，定量资料采用均数±标准差统计描述，HIV疾病进程的影响因素分析采用重复测量数据分析、Logistic多元回归分析、K-M法生存分析及Cox回归分析。
　　研究结果:1.Meta分析共纳入13篇文献。8篇关于HLA-B基因多态性与HIV疾病进程，研究结果显示，HLA-B*27、HLA-B*51、HLA-B*58和HLA-B*35等位基因的合并OR值及95％CI分别为0.49(0.26～0.92)、0.61(0.44～0.85)、0.65(0.43～0.98)和1.87(1.24～2.82); HLA-Bw4/Bw4、HLA-Bw4/Bw6、HLA-Bw6/Bw6基因型的合并OR值及95％CI分别为0.61(0.42～0.90)、0.76(0.58～0.99)、1.67(1.28～2.19)。5篇HLA-B基因多态性与HIV易感性的关联性研究提示HLA-B*37、HLA-B*46和HLA-B*39等位基因的合并OR值及95％CI分别为1.62(1.04～2.52)、1.19(1.02～1.39)和0.67(0.47～0.95)。2.343例HIV/AIDS人群和354例健康人群的KIR3DS1基因检出频率分别为37.0％、52.5％，基因频率分别为0.206、0.311。KIR3DS1基因在健康人群和HIV/AIDS人群的检出率差异具有统计学意义（x2=16.952，P=0.0007）。3.疾病进展缓慢人群中HLA-Bw4/Bw4基因型检出率较高。HLA-Bw4/Bw6、HLA-Bw6/Bw6基因型检出率在不同疾病进程人群中未见统计学差异。不同KIR3DS1/HLA-B联合表达在不同疾病进程人群中也未见统计学差异。4.本研究人群感染HIV-1亚型包括B（欧美）、C（南非C、印度C）两种亚型和01_AE、07_BC、08_BC、15_01B四种流行重组型。其中01_AE所占比例最高(58.6％)，07_BC、15_01B病毒变异性最大。不同性别、年龄、婚姻状况、传播途径人群的病毒亚型存在明显的分布差异(P＜0.05)，同性传播人群比异性传播人群的重组型01_AE比例更高(P＜0.05)。5.HIV感染后未用药人群CD4计数随时间变化呈波动变化但总体呈下降趋势。6.KIR3DS1基因与HIV感染后未用药人群的疾病进展呈负相关(P＜0.05)。7.用药人群中研究发现感染途径为同性传播与HIV/AIDS疾病进展呈正相关(P＜0.05)。8.01_AE与AIDS的发生呈正相关(P＜0.05);KIR3DS1基因与AIDS的发生呈负相关（P＜0.05）。
　　研究结论:
　　1.Meta分析结果提示HLA-Bw4/Bw4、HLA-Bw4/Bw6基因型与感染HIV后疾病进展呈负相关;HLA-Bw6/Bw6基因型与感染HIV后疾病进展呈正相关。
　　2.具有KIR3DS1基因者对HIV易感性相对较低，且与感染HIV后疾病进展呈负相关。
　　3.HIV-1的01_AE亚型与AIDS的发生呈正相关，且同性性传播人群01_AE亚型的感染比例更高，为解释MSM人群感染HIV后的疾病快速进展提供了一定的依据。
　　4.传播途径与HIV感染后疾病进展相关，其机制需进一步探讨。

目录

声明

摘要

缩略词中英文对照

前言

第一章 中国人群HLA-B基因多态性与HIV关联性的Meta分析

1．1 材料与方法

1．1．1 资料来源

1．1．2 纳入与排除标准

1．1．3 文献筛选评估与信息提取

1．1．4 统计分析

1．2 结果

1．2．1 文献检索结果

1．2．2 Meta分析结果

1．2．3 敏感性分析结果

1．2．4 发表偏倚评估

1．2．5 失安全系数计算

1．3 讨论

第二章 KIR／HLA基因多态性与疾病进展关系

2．1 研究对象与方法

2．1．1 研究对象

2．1．2 调查内容

2．1．3 静脉血采集

2．1．4 CD4+T淋巴细胞绝对计数

2．1．5 KIR3DS1基因检测

2．1．6 HLA-B基因型检测

2．1．7 HIV／AIDS人群的病程进展分组方法

2．1．8 实验的质量控制

2．1．9 伦理学审查

2．1．10 统计与分析方法

2．2 KIR3DS1基因检测结果

2．2．1 研究对象基本特征

2．2．2 研究对象KIR3DS1位点基本情况

2．3 HLA-B基因检测结果

2．3．1 研究对象基本特征(HIV／AIDS人群)

2．3．2 研究对象HLA-B基因型基本情况

2．4 讨论

2．4．1 HIV疾病进程相关研究

2．4．2 KIR3DS1基因在HIV感染及疾病进程中的作用

2．4．3 HLA-B基因型在HIV感染后疾病进程中的作用

2．4．4 本研究存在的不足和进一步研究建议

第三章 HIV-1亚型与疾病进展的关联研究

3．1 研究对象与方法

3．1．1 研究对象

3．1．2 调查内容

3．1．3 静脉血采集

3．1．4 CD4+T细胞绝对计数

3．1．5 HIV亚型鉴定

3．1．6 HIV／AIDS人群的病程进展分组方法

3．1．7 实验的质量控制

3．1．8 伦理学审查

3．1．9 统计分析方法

3．2 结果

3．2．1 HIV／AIDS人群基本特征

3．2．2 PCR扩增及序列鉴定

3．2．3 HIV／AIDS患者病毒亚型流行特征

3．2．4 不同疾病进展组的亚型分布差异

3．2．5 HIV-1亚型、KIR／HLA及其他环境因素对AIDS病程影响的生存分析

3．3 讨论

3．3．1 江苏省无锡市HIV／AIDS人群的基本特征

3．3．2 HIV-1 env区域PCR扩增及亚型鉴定

3．3．3 研究对象病毒亚型流行特征

3．3．4 疾病进程影响因素

3．3．5 本研究存在的不足和进一步研究建议

小结

参考文献

附录

综述：HIV-1亚型及其研究进展

致谢

作者简介