笃斯越橘及其白果变种果实类黄酮化合物成份与转录组比较

摘要

本研究以笃斯越橘及其白果变种成熟期果实为试材，应用常规方法测定营养指标，采用HPLC法测定10种类黄酮化合物含量，应用高通量测序技术，进行转录组测序，将试验结果进行综合分析，得出结论如下:
　　1.白果变种与笃斯越橘的成熟果实营养指标比较，白果变种成熟果实可滴定酸、还原型抗坏血酸含量较低，笃斯越橘成熟果实还原糖、可溶性糖、多酚、类黄酮、花青素含量较高。
　　2.HPLC法测定的10种类黄酮化合物，其中对香豆酸、二氢杨梅素、儿茶素、表儿茶素含量，白果变种高于笃斯越橘;山奈酚、杨梅素、槲皮素、二氢槲皮素、原花青素B2、矢车菊素-3-葡萄糖苷含量，笃斯越橘高于白果变种。
　　3.通过对笃斯越橘与白果变种转录组测序，共获得34.62 Gb Clean Data，各样品Clean Data均达到5.30 Gb，Q30碱基百分比在88.73％及以上;组装后共获得89，725条Unigene。其中长度在1kb以上的Unigene有20，473条;对Unigene进行功能注释，共获得42，837条Unigene的注释结果。全部差异表达的基因数量是325个，其中上调表达数量是41个，下调表达基因数量是284个。
　　4.类黄酮生物合成途径中，差异表达的酶类共4种，其中上调表达酶类3种，下调表达1种;路径相关基因共计80个，DEGs基因数量3个;类黄酮路径结构基因11个，其中上调表达基因数量是9个，下调基因表达量是2个;转录因子差异表达的共计7个，其中5个显著上调表达，2个显著下调表达。
　　5.MADs-box与MYB3转录因子协调作用，可能导致CHI与LAR下调表达，进而影响白果变种果皮着色出现问题。

目录

声明

摘要

前言

1 材料与方法

1．1 试验材料

1．2 试验方法

1．2．1 笃斯越橘与白果变种成熟果实主要品质指标测定

1．2．2 HPLC法测定笃斯越橘与白果变种成熟果实类黄酮化合物

1．2．3 笃斯越橘与白果变种转录组测序分析

2 结果与分析

2．1 笃斯越橘与白果变种成熟果实主要品质指标测定

2．1．1 笃斯越橘及白果变种成熟果实中可滴定酸和Vc含量比较

2．1．2 笃斯越橘及白果变种成熟果实中可溶性糖和还原性糖含量比较

2．1．3 笃斯越橘及白果变种成熟果实中总酚、类黄酮、花青素相对含量的比较

2．2 HPLC法测定笃斯越橘与白果变种成熟果实类黄酮化合物

2．2．1 笃斯越橘与白果变种成熟果实对香豆酸含量

2．2．2 笃斯越橘与白果变种成熟果实黄酮醇类物质含量

2．2．3 笃斯越橘与白果变种成熟果实二氢黄酮醇类物质含量

2．2．4 笃斯越橘与白果变种成熟果实黄烷醇类物质含量

2．2．5 笃斯越橘与白果变种成熟果实花色素类物质含量

2．3 笃斯越橘与白果变种转录组测序分析

2．3．1 测序数据产出统计

2．3．2 组装结果的统计

2．3．3 Unigene功能注释

2．3．4 笃斯越橘和白果变种类黄酮合成途径的结构基因

2．3．5 笃斯越橘和白果变种转录组文库的转录因子

2．3．6 笃斯越橘和白果变种转录组文库的高表达转录本

2．3．7 差异表达基因筛选

2．3．8 差异表达基因GO功能注释和富集分析

2．3．9 差异表达基因KEGG通路富集分析

3 讨论

3．1 笃斯越橘与白果变种果实主要营养指标分析

3．2 HPLC法测定笃斯越橘与白果变种成熟果实类黄酮化合物

3．3 笃斯越橘与白果变种转录组Illumina测序分析

4 结论

参考文献

致谢