延边朝鲜族和汉族人群15个常染色体STR基因座遗传多态性

摘要

目的:通过对中国吉林省延边地区朝鲜族人群与汉族人群常染色体上CSF1PO、D7S820、 D8S1179、D21S11、D2S1338、D3S1358、D13S317、 D16S539、TH01、D18S51、 D19S433、TPOX、vWA、D5S818、FGA这十五个STR基因座的检测和数据分析，评价其法医学价值，为法医学个体识别、亲权鉴定、人类遗传学及其他相关学科提供参考数据。
　　方法:研究对象选取延边朝鲜族无血缘个体血样224例，延边汉族无血缘个体血样407例，全部血样均按照Chelex-100方法来进行DNA的提取，获取的DNA样本通过AmpFlSTR(@)Identifiler(@)Plus PCR Amplification Kit扩增常染色体中十五个STR基因座。扩增后产物的检测使用ABI310型DNA序列分析仪来完成，检测出来的数据通过GeneScan Analysis3.7和Genetyper3.7这两种基因分析软件来处理。针对研究中涉及的十五个STR基因座的多态性参数按照Modified-Powerstates标准版的计算模式来处理。同时，选择中国境内6个民族群体以及5个外国民族群体常染色体中的这十五个STR基因座进行对比分析，为群体遗传学的研究提供基础数据资料。根据POPTREE2软件的Neighbour-Joining(N-J)法设计的研究模式，按照等位基因频率来确定遗传距离，最终形成完整的系统进化树。
　　结果:延边朝鲜族人群中的15个STR基因座共检出等位基因157个，基因频率在0.001-0.513之间;共检出基因型415种，基因型频率在0.004-0.317之间;杂合度分布在0.625-0.866之间，平均杂合度为0.7732，多态信息含量(PIG)分布在0.57-0.85之间，个人识别力(DP)在0.800-0.966之间，累计个人识别力(TDP)大于0.999999999，非父排除率(EP)分布在0.322-0.727之间，累计非父排除率(CEP)大于0.99999729延边汉族人群中的15个STR基因座共检出等位基因158个，基因频率在0.001-0.546之间;共检出基因型531种，基因型频率在0.002-0.309之间;杂合度分布在0.604-0.853之间，平均杂合度为0.7712，多态信息含量(PIC)分布在0.55-0.85之间，个人识别力(DP)在0.790-0.966之间，累计个人识别力(TDP)大于0.999999999，非父排除率(EP)分布在0.296-0.700之间，累计非父排除率(CEP)大于0.99999763中国吉林省延边地区的朝鲜族与汉族这两个民族群体在进行遗传距离的分析中可以看出，周边其他民族群体与朝、汉两民族群体之间的遗传距离要明显小于地理位置更远的其他民族群体。延边朝鲜族和汉族与国内外11个民族群体的系统进化树结果显示延边朝鲜族与韩国之间的亲缘关系最近。
　　结论:延边朝鲜族和汉族的15个STR基因座中除TH01、D3S1358与TOPX外其它均显示高度多态性遗传性，适合朝鲜族和汉族群体法医学鉴定。延边朝鲜族、汉族和其他群体之间均存在不同程度的差异性，可阐明建立群体数据库的必要性。

目录

声明

摘要

第一章 前言

第二章 材料与方法

2．1 研究对象

2．2 主要试剂

2．3 主要仪器设备

2．4 方法

2．5 数据处理

第三章 结果

3．1 延边朝鲜族和汉族人群15个常染色体STR基因座等位基因频率分布

3．2 延边朝鲜族和汉族人群15个常染色体STR基因座基因型分布及H-W平衡检验

3．3 延边朝鲜族和汉族人群15个常染色体STR基因座遗传学参数

3．4 遗传距离计算和系统进化树

第四章 讨论

4．1 15个STR基因座的特点

4．2 延边朝鲜族和汉族15个常染色体STR基因座遗传多态性

4．3 延边朝鲜族和汉族人群与其他人群的群体遗传学关系

第五章 结论

参考文献

致谢