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分枝杆菌菌种鉴定及北京家族蛋白质组学初步研究

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摘要

目的:鉴定我国致病性非结核分枝杆菌(NTM)、龟-脓肿分枝杆菌复合群的菌种;探讨分枝杆菌快速分子鉴定技术;分析结核分枝杆菌(MTB)北京家族和卡介苗(BCG)的蛋白质组及其差异。
   方法:用L-J和PNB/TCH培养基对经地方实验室鉴定为NTM的临床菌株复核鉴别后,用hsp65和rpoB PCR-RFLP对NTM分类鉴定;用细菌学、探针杂交和以16s rRNA、.16s-23s rRNA、rpoB、hsp65、recA和sodA为靶标的多靶位技术对龟-脓肿分枝杆菌复合群进行亚种鉴定。蛋白质组研究采用双向凝胶电泳和质谱技术。
   结果:复核鉴定178株菌株中MTB27株、牛分枝杆菌1株和NTM150株。NTM中胞内分枝杆菌72株、脓肿分枝杆菌群27株、戈登分枝杆菌12株、鸟分枝杆菌11株、偶发分枝杆菌9株、堪萨斯分枝杆菌2株、猿分枝杆菌1株、冬天分枝杆菌1株、M.arupense1株和未定种14株。脓肿分枝杆菌群中脓肿分枝杆菌19株、马赛分枝杆菌3株和鉴定出龟-脓肿复合群新亚种(福建分枝杆菌)5株。分析了北京家族菌株765个蛋白质点,发现了6种特有蛋白质和2种表达明显增加的蛋白质。
   结论:中国NTM肺病病原种类繁多,以胞内分枝杆菌群和龟-脓肿分枝杆菌复合群为主。龟-脓肿分枝杆菌复合群至少含有三种亚种,并首次发现了龟-脓肿分枝杆菌复合群福建分枝杆菌。多靶位分子检测技术联合能有效对NTM进行种和亚种鉴定。北京家族与BCG蛋白组间存在明显差异。

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