油菜杂种优势分子标记剖析及菌核病抗性相关基因筛选

摘要

该研究采用单向方差分析的方法鉴定了一批对杂种优势有显著贡献的分子标记,在0.01水平上1999年和2000分别检测到126和215个阳性标记,其中93个具有很好的重复性.研究表明该种间F<,1>杂种优势的产生不仅受杂合位点的影响,受纯合位点的影响也很大,而且杂合位点和纯合位点对杂种优势的贡献都有两面性,即都存在有利或不利的杂合位点和有利或不利的纯合位点.在杂种中,一般有利纯合位点的比例和不利纯合位点的比例差不多,而有利杂合位点的比例往往比不利杂合位点的比例高得多.因此,现有杂种优势的产生多数是由于杂合位点的贡献,而纯合位点的效应尚未得到有效利用.根据这一结果,该研究首次提出将杂种优势在有利杂合位点、不利杂合位点、有利纯合位点和不利纯合位点进行分解的数学模型,显著提高了所解释杂种优势的表现型方差,更合理的揭示了杂种优势复杂的遗传基础的部分内容.而且,研究还表明采用该模型能显著提高杂种优势预测的准确性,为杂种优势的预测和利用提供了新的思路.另外该研究还筛选了30个对杂种优势有

目录

摘要

ABSTRACT

Part Ⅰ油菜杂种优势在分子标记水平上的剖析以及相关的生物信息学分析

1文献综述

1.1杂种优势的遗传基础

1.2杂种优势遗传基础研究进展

1.3甘白种间杂交育种与杂种优势利用

2实验的目的和意义

3材料与方法

3.1亲本与组合的选配

3.2田间试验设计

3.3亲本材料的分子标记分析

3.4统计分析

4结果分析与讨论

4.1 RFLP多态性分析

4.2基因的拷贝数分析

4.3 AFLP标记的多态性分析

4.4聚类分析

4.5甘蓝型油菜和白菜型油菜种间杂交结果分析

Part Ⅱ菌核病抗性相关基因在表达水平上的筛选,以及相关的生物信息学分析

1文献综述

1.1菌核病的危害

1.2核盘菌的习性和生活周期

1.3核盘菌的致病机理研究进展

1.4油菜及其它主要作物抗菌核病研究进展

1.5 DNA芯片的产生及其在油菜研究中的意义

2本研究的目的与意义

3材料和方法

3.1实验材料

3.2盆栽苗活体接种

3.3 RNA提取

3.4 DNA芯片杂交探针的标记与纯化

3.4 DNA芯片的杂交与信号检测

3.5 RT-PCR分析

3.6 Northern杂交分析

4结果与分析

4.1宁RS-1对菌核病的反应

4.2芯片杂交前对合成探针的质量控制

4.3拟南芥cDNA芯片应用于油菜基因组表达研究的效果评价

4.4 DNA芯片杂交结果

4.5部分克隆的表达验证

5 讨论

5.1应用油菜DNA芯片研究油菜基因表达的效果

5.2本实验筛选的部分基因在植物抗病反应中的作用

Part Ⅲ本研究开发的数据分析软件

1前言

2软件介绍

2.1遗传连锁图绘制软件MapDraw

2.2单标记分析软件Oneway ANOVA

2.3偏分离检测程序

2.4标记快速筛选软件Marker Select

2.5杂合性统计程序Hetero_Bands_Stat

2.6两位点方差分析程序Twoway_ANOVA

3讨论

3.1 Microsoft Excel宏功能在数据分析中的作用

3.2 Microsoft Excel宏软件的缺点

参考文献

附录1荧光标记试剂盒使用说明书

附录2本论文开发的软件光盘

作者简介

致谢