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论文说明:缩略语表
声明
1文献综述
1.1单核细胞增生李斯特菌生物学特性
1.1.1基本特征
1.1.2分布
1.1.3生活周期
1.1.4对理化因素的抵抗力
1.1.5血清学分型
1.1.6主要毒力因子
1.1.7李斯特菌病的临床特征
1.1.8李斯特菌病的暴发情况
1.2单核细胞增生李斯特菌检测技术
1.2.1生化鉴定技术
1.2.2免疫学检测技术
1.2.3核酸分子杂交检测技术
1.2.4 PCR检测技术
1.3荧光定量PCR的原理和分类
1.3.1原理
1.3.2分类
1.3.3存在的缺点
1.4扩增内标的研究概况
1.4.1导致假阴性出现的原因
1.4.2扩增内标在PCR检测中的应用
1.4.3扩增内标的制备方法
1.5研究目标
2单核细胞增生李斯特菌的鉴定与验证
2.1材料与方法
2.1.1菌株
2.1.2培养基
2.1.3主要试剂及配制
2.1.4主要仪器设备
2.1.5菌株的培养和革兰氏染色
2.1.6 Biolog细菌鉴定系统
2.1.7 VITEK-32全自动微生物鉴定/药物分析系统
2.1.8 BD BBLCrystal细菌鉴定系统
2.1.9基于PCR技术的细菌鉴定方法
2.1.10血清学鉴定
2.2结果与分析
2.2.1 Biolog鉴定结果
2.2.2 VITEK-32鉴定结果
2.2.3 BD BBLCrystall鉴定结果
2.2.4 PCR方法鉴定结果
2.2.5各种鉴定方法的比较
2.2.6血清学鉴定结果
2.3讨论
3单核细胞增生李斯特菌活菌内标序列的设计与合成
3.1材料与方法
3.1.1菌种和质粒
3.1.2培养基及试剂的配制
3.1.3仪器和设备
3.1.4hly基因的保守区段分析
3.1.5特异性检测引物与探针的设计
3.1.6扩增内标序列的设计
3.1.7扩增内标序列的合成
3.1.8扩增内标序列与载体连接
3.1.9感受态细胞的制备
3.1.10连接产物的转化
3.1.1l阳性转化子的筛选
3.1.12质粒的提取
3.1.13阳性克隆的测序鉴定
3.2结果与分析
3.2.1hly基因序列比对结果
3.2.2引物与探针的合成
3.2.3扩增内标序列的筛选结果
3.2.4扩增内标序列的PCR检测
3.2.5阳性克隆片段的序列测定
3.3讨论
4带有内标序列的单核细胞增生李斯特菌突变株的构建
4.1材料与方法
4.1.1菌株
4.1.2培养基
4.1.3质粒
4.1.4主要试剂及溶液的配制
4.1.5主要仪器设备
4.1.6 DNA模板的提取
4.1.7引物的设计与合成
4.1.8 PCR扩增
4.1.9 PCR产物及载体的酶切、回收与纯化
4.1.10 DNA片断的连接
4.1.11感受态细胞的制备
4.1.12连接产物的转化
4.1.13重组质粒的快速鉴定
4.1.14质粒的提取
4.1.15重组质粒的酶切鉴定
4.1.16同源重组质粒pKSV7-UIKD的构建
4.1.17单核细胞增生李斯特菌感受态细胞的制备
4.1.18电转单核细胞增生李斯特菌感受态细胞
4.1.19质粒的提取
4.1.20阳性转化子的菌落PCR及酶切鉴定
4.1.21同源交换突变株的筛选
4.1.22同源交换突变株的PCR鉴定
4.1.23同源交换突变株的RT-PCR鉴定
4.1.24突变株内标序列的测序分析
4.2结果与分析
4.2.1 hly基因上游和下游同源片段的PCR扩增
4.2.2中间质粒pSK-UIKD的构建
4.2.3同源重组质粒pKSV7-UIKD的构建
4.2.4质粒pKSV7-UIKD的酶切鉴定
4.2.5同源交换突变株的获得
4.2.6同源交换突变株的PCR验证结果
4.2.7同源交换突变株的RT-PCR验证结果
4.2.8突变株内标序列的测序分析结果
4.3讨论
4.3.1同源重组质粒pKSV7-UIKD的构建
4.3.2同源重组质粒pKSV7-UIKD的电转化
4.3.3同源交换突变株的筛选与鉴定
5添加活菌内标的荧光定量PCR检测方法的研究
5.1材料与方法
5.1.1菌株
5.1.2培养基
5.1.3主要试剂
5.1.4主要仪器设备
5.1.5菌种活化与培养
5.1.6基因组DNA提取
5.1.7含扩增内标荧光定量PCR检测方法的建立
5.1.8含扩增内标荧光定量PCR检测方法的评价
5.1.9活菌内标在准确定量中的运用(LM-IACAQ-PCR)
5.1.10活菌内标在全程监控假阴性中的运用(LM-IAC EQ-PCR)
5.2结果与分析
5.2.1荧光阈值的设定
5.2.2TaqMan探针浓度的选择
5.2.3活菌内标添加量的确定
5.2.4特异性评价
5.2.5灵敏度评价
5.2.6 DNA提取方法的选择
5.2.7野生菌和活菌内标PCR扩增效率的评价
5.2.8野生菌和活菌内标DNA提取效率的评价
5.2.9回归方程的建立
5.2.10 LM-IAC AQ-PCR定量方法的评价
5.2.11野生菌与活菌内标生化特性比较
5.2.12野生菌和活菌内标生长曲线的测定
5.2.13混合培养中活菌内标平板计数卡那霉素加入量的确定
5.2.14混合培养中活菌内标加入量对野生菌生长的影响
5.2.15 LM-IAC EQ-PCR全程监控假阴性的评价
5.3讨论
5.3.1活菌内标在单核细胞增生李斯特菌准确定量中的运用
5.3.2活菌内标在荧光定量PCR检测中全程监控假阴性的运用
6添加多重扩增内标的PCR检测方法的建立
6.1材料与方法
6.1.1供试菌株
6.1.2培养基及试剂的配制
6.1.3仪器和设备
6.1.4 DNA模板的提取和定量
6.1.5含多重扩增内标的PCR检测方法(mlAC PCR)的建立
6.1.6 PCR结果的电泳检测
6.1.7 mlAC PCR检测方法的评价
6.2结果与分析
6.2.1多重内标的PCR验证
6.2.2未添加多重扩增内标时的纯DNA检测灵敏度
6.2.3添加有多重扩增内标时的纯DNA检测灵敏度
6.2.4 mlAC PCR检测方法特异性评价
6.2.5人工污染样品的检测
6.3讨论
7结论及创新性
7.1结论
7.2特色和创新
参考文献
致谢
附录
华中农业大学;