7个微卫星标记与波尔山羊生长性状的关联分析

摘要

本研究采用了微卫星、PCR－RFLP两种方法旨在寻找与波尔山羊生长以及繁殖性状相关的标记。具体研究结果如下：
　　 1．选择与羊生长力相关联的微卫星基因座MCM218、OARFCB005、MAF050、 MCM064、ETH225、HEL04和LSCV11，分析其在150只波尔山羊群体中的遗传多态性及与波尔山羊生长性状的关系。结果表明微卫星．MCM218的178/178基因型，MAF050的181/181基因型，OARFCB005的202/202与220/198基因型，ETH225的157/167基因型以及微卫星MCM064的193/167基因型对波尔山羊的出生性状有正效应；MCM218的198/172基因型，MAF050的163/163基因型，OARFCB005的等位基因224bp，微卫星MCM064的195/195基因型，微卫星HEL04的159/159基因型和135/135基因型对波尔山羊的出生性状有负效应；微卫星MCM218的178/178基因型，微卫星ETH225的153/183基因型对波尔山羊的三月龄性状有正效应，微卫星MCM218的198/172基因型，ETH225的157/160基因型，微卫星OARFCB005的194/194基因型对波尔山羊的三月龄重以及三月龄体长有负效应；微卫星MAF050的187/167基因型对波尔山羊的周岁性状有正效应，微卫星LSCV11的171/153基因型，微卫星MCM218的198/172基因型对波尔山羊的周岁重性状有负效应，202/178基因型对周岁体长有负效应。
　　 2．将三个微卫星的固定效应进行合并观察它们与波尔山羊周岁性状的相关性，发现大多数合并基因型的最小二乘均值达到了显著水平（P<0.05）。
　　 3．分析4个山羊品种共348只山羊的PRLR基因第十外显子的部分序列，结果马头山羊、杂种马头山羊和波尔山羊中发现存在突变，努比山羊未发现突变位点。
　　 4．利用3个微卫星标记（LSCV11、MCM218、MAF050）对波尔山羊、马头山羊和努比山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行检测，结果表明：3个微卫星位点在3个山羊群体中多态性较丰富，可以用于山羊遗传多样性的评估：山羊品种遗传变异程度从大到小依次为：马头山羊>努比山羊>波尔山羊。

目录

文摘

英文文摘

论文说明：缩略词表(Abbreviations)

声明

1文献综述

1.1山羊产业在我国的发展状况

1.2分子标记辅助育种的研究进展

1.2.1 RFLP标记

1.2.2 RAPD标记

1.2.3 SSCP标记

1.2.4 SSR标记

1.2.5 SNP标记

1.3微卫星标记研究进展

1.3.1微卫星标记产生机理

1.3.2微卫星的功能

1.4微卫星的选择

1.5微卫星标记在动物育种中的研究进展

1.6 PRLR基因的研究进展

2.研究目的与意义

3.微卫星标记与波尔山羊生长性状的相关研究

3.1材料

3.1.1实验动物与样品采集

3.1.2主要仪器设备

3.1.3主要试剂

3.2实验方法

3.2.1山羊基因组DNA提取、浓度测定和质量检测

3.2.2 PCR产物琼脂糖凝胶电泳检测

3.2.3聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测

3.2.4 PCR-RFLP

3.3引物设计及PCR反应条件

3.3.1微卫星标记引物及反应条件

3.3.2 PRLR基因引物设计及扩增条件

4统计分析

4.1等位基因频率和平均杂合度(H)

4.2多态信息含量

4.3有效等位基因数(Ne)

4.4标记基因型与波尔山羊生长性状间的关系

5.结果与分析

5.1山羊基因组DNA的检测

5.2微卫星多态性检测

5.2.1琼脂糖凝胶电泳检测结果

5.2.2聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果

5.3波尔山羊中各微卫星基因型与生长性状的相关性分析

5.3.1微卫星不同基因型对出生性状的影响

5.3.2微卫星不同基因型对三月龄重的影响

5.3.3微卫星不同基因型对周岁重的影响

5.3.4微卫星合并基因型对波尔山羊周岁生长体重的效应分析

5.4 3个山羊品种间的遗传变异

5.5微卫星基因座的多态信息含量(PIC)

5.6微卫星基因座的有效等位基因数

5.7 3个山羊品种在三个微卫星基因座上的杂合度

5.8 PRLR基因第十外显子的酶切多态性分析

6.讨论

6.1微卫星的检测

6.2等位基因数

6.3杂合度

6.4多态信息含量

7 小结

参考文献

致 谢