复杂疾病基因定位的统计方法研究

摘要

目前，基因定位统计方法的有效性直接影响到定位和克隆研究的进程，因此复杂疾病基因定位的统计方法的研究已经成为了当代统计学家和遗传学家面临的主要挑战和任务。由于关联分析对于确定复杂疾病的致病基因位点具有较高的功效，所以关联分析成为了学者研究的重点和热点。近年来，随着基因测序技术的完善，大量的SNPs位点被用于关联分析的研究，并且已有很多研究表明基于多个SNP标记位点单体型的关联性检验比基于单个标记位点的关联性检验的功效更高。因此，建立一个“较好”的关联性检验统计量对于复杂疾病的基因定位及进一步治疗具有十分重要的意义。
　　本文分析了连锁分析与关联分析的差异，并介绍了关联分析当前的研究现状、分类及其研究热点，重点对基于群体数据的基因组范围内关联分析进行了研究。关于基因组范围内的病例-对照设计，虽然有人提出了比标准χ2检验统计量的检验功效更高的Shannon熵检验统计量，但是无论哪一个统计量都不是“最优”的。因此，本文针对病例-对照设计，提出了基于SNP标记位点单体型的新的关联性检验统计量，并详细论证和分析了新的检验统计量的性质，模拟了新的检验统计量的分布情况。对新的检验统计量与Shannon熵检验统计量的功效进行了同等假设条件下的比较分析，说明了新的检验统计量是“相对”更有效的。

目录

复杂疾病基因定位的统计方法研究

STATISTICAL STUDIES ON GENE MAPPING OF COMPLEX DISEASE

摘要

Abstract

目 录

第 1 章 绪论

1.1 基因定位统计方法研究的背景和意义

1.2 国内外关于基因定位统计方法的研究现状

1.3 国内外基因定位统计方法的现状分析

1.4 本文的主要工作

第 2 章 基于加权熵的检验统计量

2.1 基于加权熵的函数变换

2.2 针对关联性检验的加权熵统计量

2.3 随机模拟基于加权熵检验统计量的分布

2.4 本章小结

第 3 章 加权熵统计量与Shannon熵统计量

3.1 加权熵检验统计量与Shannon熵统计量的联系

3.2 功效比较

3.3 本章小结

结 论

参考文献

附录 A

A.1

A.2

A.3

哈尔滨工业大学硕士学位论文原创性声明

哈尔滨工业大学硕士学位论文使用授权书

致 谢