中国西门塔尔牛遗传评估技术体系的建立

摘要

本研究对中国西门塔尔牛遗传评估技术体系的核心遗传评估部分进行了完整的阐述。包括遗传评估数据的存储、整理、编辑和计算等细节问题。存储工作主要由底层数据库来完成，在设计和创建坚实可靠的育种数据库解决方案的基础上，利用BASE SAS进行数据的操作。针对文本型变量和数字型变量编写了可重复使用的宏代码库，在数据导入数据库前对数据进行严格的检查和修正，从而保证遗传评估数据的质量。计算部分则阐述了现代动物育种的理论与算法，包括单性状动物模型BLUP、阈模型、广义线性混合模型和随机回归测定日模型。为正确选择遗传评估统计方法提供了支持，保证了结果的可靠性。文章最后部分利用数据库检索出中国西门塔尔牛第一胎次泌乳评分记录和多个胎次的不同泌乳天数的累计产奶量记录，分别配合阈模型和随机回归模型进行遗传参数的估计。文中同时也涉及了我们在遗传评估工作中遇到的几个细节问题，比如个体号的统一及编制和年龄的计算等等。主要的研究结果包括以下几个个方面：
　　 1.建立了中国西门塔尔牛遗传评估技术体系。并在文中详尽的阐述了该模式所涉及的所有问题。
　　 2.利用SQL Server2008设计并初步建立了中国西门塔尔牛的育种数据库；
　　 3.阐述了数据收集整理后，导入数据库前，需要进行的各项数据检查，包括无效值、异常值、缺失值和重复值等几个方面，并在文中给出了具体实现的方法；
　　 4.配合多分类阈模型对中国西门塔尔牛第一胎次的泌乳速度评分性状进行遗传参数估计，并与常规线性混合模型的结果进行了比较。该性状遗传力的估计值为0.22-0.25，表明泌乳速度评分属于中等遗传力性状。阈模型对此类评分性状的分析更具有优势。
　　 5.利用随机回归模型，考虑胎次和泌乳天数，对累计产奶量数据进行遗传分析。基于各随机回归系数及其方差的估计值，对各胎次不同泌乳天数的遗传力变化进行了讨论。6个胎次305天产奶量的遗传力估计值分别为0.28，0.30，0.32，0.32，0.32，0.31。
　　 本研究涉及了家畜个体遗传评估的方方面面，从保证数据有效性到选取适当的复杂模型进行遗传分析。为提高中国西门塔尔牛重要经济性状的遗传评估准确性奠定了理论基础。

目录

文摘

英文文摘

Contents

1.引言

1.1 中国西门塔尔牛遗传评估概述

1.1.1 西门塔尔牛简介

1.1.2 中国西门塔尔牛育种存在的问题

1.1.3 中国西门塔尔牛经济性状遗传分析概述

1.2 遗传评估的统计理论基础

1.2.1 线性统计模型

1.2.2 线性混合模型

1.2.3 遗传模型

1.2.4 方差组分估计

1.2.5 线性方程组迭代求解的基本思想

1.2.6 贝叶斯方法估计方差组分与育种值

1.2.7 广义线性混合模型

1.2.8 重复观察值模型

1.2.9 遗传评估统计理论脉络

1.3 本研究的内容和意义

2.中国西门塔尔牛遗传评估体系构建

2.1 本研究采用的遗传评估模式

2.2 设计和创建数据库

2.2.1 育种数据库建立的意义

2.2.2 数据库产品的选择

2.2.3 数据库类型的确定

2.2.4 确定存储在数据库中的信息

2.2.5 育种数据库主表字段的讨论

2.2.6 数据库构建的工具

2.3 数据操作

2.3.1 数据操作的工具

2.3.2 数据清理

2.3.3 数据导入与检索

3.性状的遗传分析

3.1 本研究采用的遗传分析计算软件

3.2 泌乳速度评分性状的遗传分析

3.2.1 采用的统计模型

3.2.2 数据检索与固定效应的筛选

3.2.3 性状分析结果与讨论

3.3 累计产奶量性状的遗传分析

3.3.1 采用的统计模型

3.3.2 数据检索与固定效应的筛选

3.3.3 性状分析结果与讨论

4.下一步工作的建议

致 谢

参考文献

攻读学位期间发表的学术论文