声明
摘要
1前言
1．1罗伊氏乳杆菌介绍
1．1．1罗伊氏乳杆菌基本特性
1．1．2罗伊氏乳杆菌的益生功能
1．1．3罗伊氏乳杆菌的应用
1．2免疫功能
1．2．1乳酸菌对免疫的影响
1．2．2乳酸菌的免疫调节成分
1．2．3罗伊氏乳杆菌的免疫作用
1．3基因组测序技术与比较基因组
1．3．1基因组测序技术简介
1．3．2基因组测序技术在乳酸菌中的应用
1．3．3比较基因组在乳酸菌中的应用
1．4研究的目的与意义
1．5研究内容
2材料与方法
2．1材料与仪器
2．1．1试验菌株及细胞
2．1．2主要生化试剂
2．1．3主要仪器与设备
2．1．4主要溶液的配制
2．2试验方法
2．2．1菌株活化与保藏
2．2．2菌株鉴定
2．2．3黏附能力评价
2．2．4生长曲线及胃肠道耐受性试验
2．2．5抑菌能力评价
2．2．6免疫相关基因表达体外评价
2．2．7数据与图像分析
2．2．8罗伊氏乳杆菌J1全基因组测序
2．2．9免疫功能基因挖掘
2．2．10比较基因组学分析
3．结果与分析
3．1菌株鉴定
3．1．1形态学观察
3．1．2 SEM观测结果分析
3．1．3 16S rDNA鉴定
3．2罗伊氏乳杆菌J1黏附能力评价
3．3罗伊氏乳杆菌J1收获期的确定及胃肠道耐受性评价
3．3．1收获期的确定
3．3．2耐酸性评价
3．3．3耐胆盐评价
3．3．4耐人工胃肠液评价
3．3．5耐盐性评价
3．4罗伊氏乳杆菌J1抑菌能力评价
3．5免疫相关基因表达的体外评价
3．5．2免疫相关基因表达量动态变化
3．6基因组测序质量分析
3．7罗伊氏乳杆菌J1基因组特征分析
3．7．1基因组的基本特点
3．7．2基因组基因预测及功能注释
3．7．3基因组组分分析
3．7．4免疫功能基因挖掘
3．8比较基因组分析
3．8．1泛基因与核心基因分析
3．8．2基因进化分析
3．8．3平均核苷酸一致性分析
4讨论
4．1黏附能力评价
4．2环境耐受性评价
4．2．1酸耐受性评价
4．2．2胆盐耐受性评价
4．2．3人工胃肠液耐受性评价
4．2．4盐耐受性评价
4．3抑菌能力分析
4．3．1发酵上清液抑菌能力分析
4．3．2甘油发酵液抑菌能力分析
4．4免疫相关基因表达的分析
4．5基因组特点分析
4．6免疫功能基因分析
4．7比较基因组学分析
5结论
致谢
参考文献
攻读硕士学位期间发表的学术论文
