微卫星标记和pit-1基因与杂种猪肉质性状和胴体性状的相关分析

摘要

选用位于13号染色体上的8个微卫星标记对176头杂种猪的基因组DNA进行PCR扩增，扩增结果用聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分型，分析微卫星标记的多态性及其与肌肉颜色、大理石花纹、pH1值、pH2值、剪切力、含水率、肌内脂肪等7个肉质性状和1个胴体性状背膘厚之间的相关性。含水率与肌内脂肪，背膘厚的相关系数分别为-0.771，-0.251，肌内脂肪与背膘厚的相关系数为0.427。SW864与肌内脂肪含量、大理石花纹相关；S0222与肌肉颜色、肌内脂肪含量，大理石花纹，背膘厚存在相关性；sw882与肌内脂肪含量、大理石花纹相关；SW937与背膘厚相关。上述结果表明，在微卫星SW864、S0222、SW882和SW937位点附近可能存在影响肉色，肌内脂肪和背膘厚性状的QTL。同时微卫星与各性状进行多重比较表明，SW864座位AA基因型与AB基因型差异显著，对于大理石纹与肌内脂肪：在表型效应上AA基因型比AB基因型高出0.27和0.013左右，因此推测A(184bp)基因与控制大理石纹和肌内脂肪相关的QTL连锁。S0222座位AB基因型与AC基因型差异显著，对于肌内脂肪，大理石纹，肌肉颜色与背膘厚：在表型效应上AB基因型均比AC基因型高，因此推测B(206bp)基因与控制这些性状相关的QTL连锁。SW882座位DE基因型与AB、CA、DB、BE间差异显著，DB与BE差异不显著，在表型效应上BE比DB的高，说明E(90bp)基因与控制大理石花纹相关的QTL连锁。对于肌内脂肪：DE基因型同样与AB、CA、DB、BE间差异显著，在表型效应上在表型效应上DB比BE的高，说明D(102bp)基因与控制肌内脂肪相关的QTL连锁。SW937座位CA基因型与AB基因型差异显著。
　　 同时对Pit-1基因第1内含子上扩增长度为2239bp的片段，检测到一个300多bp的缺失，通过软件预测此多态位点存在着影响基因转录的调控位点，并且在第1内含子发现的突变位点AA基因型与AB基因型对背膘厚差异显著，在表型效应上AB基因型比AA基因型高出0.58左右，说明B基因对于背膘厚有显著影响，上述结果表明，pit-1基因第1内含子影响着基因转录水平，为pit-1基因作为肉质性状的候选基因提供依据。并对不同物种间Pit-1基因遗传分化进行分析，所有物种的平均Dxy值为0.1802。绵羊与山羊间的Dxy值最小为0.053，挪威鼠和原鸡的Dxy值最大为0.294。猪和人的平均Dxy值为0.085。

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2 材料与方法

3 结果与分析

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