原核生物中重复序列的分析及数据库的构建

摘要

该文主要分析了原核生物重复序列的收集、分类及数据库的构建.该文的前两章对生物信息学及真核生物的重复序列作了简要的概括.它是我们的具体工作（第三到第五章）的基础.第三章分析了原核生物中重复序列的收集.根据收集策略,对四十一个细胞的DNA序列进行分析,收集了其中的“短而多,长而少”的重复序列.并统计出各细菌中的重复序列的含量及重复次数最多和重复长度最长的串.第四章侧重于研究原核生物中重复序列的分类.根据重复序列落入的基因区域重复序列本身的结构特征、或长度及重复次数进行组和串的分类.第五章是在第三、第四章的基础上研究了原核生物重复序列数据库的构建.设计了数据库的库文件格式及在Oracle数据库中的具体实现.

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文摘

英文文摘

第一章生物信息学概述

1.1什么是生物信息学

1.2生物信息学的主要研究内容

1.3生物信息学的研究方法及目前发展状况和展望

第二章真核生物的重复序列

2.1真核生物与原核生物

2.2真核生物与原核生物的基因组结构

2.3真核生物的重复序列

2.4重复序列的功能

2.5调研结果

第三章原核生物中重复序列的收集

3.1引言

3.2完全基因组序列

3.3原核生物重复序列收集的策略及方法

3.4收集结果及初步分析

第四章重复序列的分类

4.1引言

4.2组分类

4.3串分类

第五章原核生物重复序列数据库的构建

5.1引言

5.2数据库文件格式

5.3数据库的设计

5.4在Oracle中的具体实现

5.5建立原核生物重复序列数据库的意义

结束语

致谢

参考文献

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