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肠出血型大肠埃希菌O157:H7 Tir--C在大肠杆菌和嗜酸乳杆菌中的表达研究

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目录

摘要

前言

第一部分 肠出血型大肠埃希菌O157︰H7 Tir基因的生物信息学分析

1.1 实验方法

1.2 实验结果

1.3 讨论

第二部分 肠出血型大肠埃希菌O157︰H7 Tir-C基因的原核表达

2.1 材料

2.2 实验方法

2.3 实验结果

2.4 讨论

第三部分 表达肠出血型大肠埃希菌O157︰H7 Tir-C基因的重组嗜酸乳杆菌菌株的构建

3.1 材料

3.2 实验方法

3.3 实验结果

3.4 讨论

全文总结

参考文献

攻读学位期间成果

附录

中英文缩略词表

致谢

声明

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摘要

一、研究背景和目的: 肠出血型大肠埃希菌(enterohaemorrhagic E.coli,EHEC)O157∶H7是一种主要经消化道传播的病原菌,可引起出血性肠炎(haemorrhagic colitis,HC)、溶血性尿毒综合症(hemolytic uremic syndrome,HUS)、血栓性血小板减少性紫癜(thrombotic thromobocytopenie porpura,TTP)等并发症,重者可致死亡,其感染的病死率为0%~10%。 自从Riley1983年首次报道由EHEC O157∶H7引起的出血性肠炎暴发以来,该菌引起的暴发流行不断发生并呈上升趋势,已成为全球性公共卫生问题。因此,预防和控制EHEC O157∶H7感染十分重要。目前,针对EHEC O157∶H7感染尚缺乏有效的防治方法,一般采取对症治疗。尽管EHEC O157∶H7对大多数抗生素比较敏感,但其被抗生素杀死后,可释放志贺毒素,加剧患者并发HUS的危险性。因此,对使用抗生素治疗应采取慎重态度。鉴于EHEC O157∶H7暴发流行的严重性和抗生素治疗上的困难,疫苗的研究极为重要。 EHEC O157∶H7的致病性主要体现在细菌的黏附定植力和毒素两个方面,而转位紧密黏附素受体(Translocation intimin receptor, Tir)是O157∶H7的一种重要毒力蛋白,经EHECⅢ型分泌系统(TypeⅢ secretion system, TTSS)分泌并转位进入宿主细胞,定位于细胞膜上,与紧密黏附素结合后,可引起宿主细胞多聚肌动蛋白聚合,造成黏附局部微绒毛刷状缘破坏,形成特征性的黏附和擦拭损伤(attaching and effacing lesion,A/E lesion),即Tir在EHEC O157∶H7的定植感染过程中起着重要的作用。因此,阻断EHEC O157∶H7感染的黏附初始阶段,可避免黏附和擦拭性损伤的发生,从而终止感染。 本研究从NCBI网站GenBank上查到EHEC O157∶H7标准株EDL933转位紧密黏附素受体完整的编码区(cds)基因序列(Accession number NC002655.2)和氨基酸序列(protein id NP290261.1),利用生物信息学在线工具和抗原表位分析软件,预测分析其蛋白结构和抗原特性,从Tir基因全长中选取抗原表位分值高的基因进行研究(命名为Tir-C);设计特异性引物,扩增目的基因Tir-C;将目的基因连至PET-30a(+)载体上,构建重组原核表达质粒PET-30a(+)-Tir-C,转化至大肠埃希菌BL21/DE3,诱导表达和纯化重组蛋白Tir-C;将目的基因克隆入乳酸菌高效组成型表达质粒PMG36e中,获得重组质粒PMG36e-Tir-C,经电穿孔法将该重组质粒转化至嗜酸乳杆菌中,构建表达EHEC O157∶H7 Tir-C基因的重组嗜酸乳杆菌活载体疫苗;进一步用原核表达的Tir-C蛋白、表达EHECO157∶H7 Tir-C基因的重组嗜酸乳杆菌、重组嗜酸乳杆菌结合原核表达的Tir-C蛋白分别免疫小鼠,观察亚单位疫苗和重组载体疫苗的免疫原性及免疫保护性,探讨与比较预防EHEC O157∶H7感染最有效的疫苗,为发展新型疫苗提供实验依据。 二、研究方法: 1.EHEC O157∶H7 Tir基因的生物信息学分析 从NCBI网站GenBank上获得EHEC O157∶H7标准株EDL933 Tir完整的编码区基因序列和氨基酸序列;运用InterProScan分析Tir氨基酸序列;同时使用两种B细胞表位在线分析软件(http://www.imtech.res.in/raghava/abcpred/与http://www.cbs.dtu.dk/services/bepipred/)预测Tir蛋白的B细胞表位。 2.目的基因Tir-C的原核表达 2.1目的基因Tir-C克隆载体的构建 根据Tir基因生物信息学分析的结果,选取Tir基因全长中的一段基因作为目的片段(Tir-C)进行研究,根据该片段的基因序列设计两条引物,通过PCR,从EHEC O157∶H7广州株882364染色体DNA中扩增出Tir-C基因,克隆入T载体pMD19-T中,构建和鉴定重组克隆载体pMD19-T-Tir-C。 2.2目的基因Tir-C表达载体的构建 利用限制性内切酶NdeⅠ和XhoⅠ,双酶切重组克隆载体pMD19-T-Tir-C,回收纯化目的基因Tir-C,与经过NdeⅠ和XhoⅠ双酶切的空质粒PET-30a(+)用T4DNA连接酶进行连接,通过PCR、双酶切及测序鉴定重组表达载体PET-30a(+)-Tir-C。 2.3目的基因Tir-C的表达、纯化和鉴定 将重组质粒PET-30a(+)-Tir-C转化至BL21/DE3中,在异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导下表达重组蛋白Tir-C,用12% SDS-PAGE鉴定,进一步利用Ni-Agarose His标签蛋白纯化试剂盒纯化蛋白。以抗6×His单克隆抗体稀释液为一抗,辣根过氧化物酶标记的羊抗小鼠IgG稀释液为二抗,通过Western blot方法,初步鉴定重组蛋白的免疫反应性。 3.表达目的基因Tir-C的重组嗜酸乳杆菌菌株的构建 3.1目的基因Tir-C的扩增 根据Tir-C基因的碱基组成及乳酸菌高效组成型表达质粒PMG36e的酶切位点,设计特异性引物,PCR扩增目的基因Tir-C。 3.2构建重组质粒PMG36e-Tir-C 将目的基因克隆入乳酸菌高效组成型表达质粒PMG36e中,获得重组质粒PMG36e-Tir-C。 3.3重组嗜酸乳杆菌菌株的构建 将重组质粒PMG36e-Tir-C,经电穿孔法转化至嗜酸乳杆菌中,构建表达EHEC O157∶H7 Tir-C的重组嗜酸乳杆菌,经革兰染色、菌落PCR、质粒PCR、双酶切、SDS-PAGE及Western blot进行鉴定。 三、结果: 1.EHEC O157∶H7 Tir基因的生物信息学分析 Tir基因全长1,677bp,起始密码子为ATG,终止密码子为TAA,共编码558个氨基酸;InterProScan分析该氨基酸序列含有三个结构和功能域,即Tir的N端、C端和与Intimin结合的M区;Bepipred分析预测有20个B细胞线性表位肽段,ABCPred分析预测有26个B细胞线性表位肽段,综合分析结果,拟取C端,即Tir基因全长中的1000bp-1674bp作为目的片段进行研究。 2.Tir-C基因的原核表达 从EHEC O157∶H7广州株882364染色体DNA中扩增出Tir-C基因,大小为675bp,与预期一致,重组质粒pMD19-T-Tir-C及重组表达质粒PET-30a(+)-Tir-C经质粒PCR、NdeⅠ和XhoⅠ双酶切和测序鉴定,证实构建成功;目的蛋白诱导表达成功,经SDS-PAGE电泳显示与理论预测的融合蛋白分子质量相符,经纯化后获得目的蛋白Tir-C。Western blot鉴定结果显示,纯化的融合蛋白在24KDa左右处出现一条特异性条带,与预期一致。 3.表达目的基因Tir-C的重组嘈酸乳杆菌菌株的构建 成功扩增出目的基因Tir-C,克隆入表达质粒PMG36e中,获得重组质粒PMG36e-Tir-C,经电穿孔法将该重组质粒转化至嗜酸乳杆菌ATCC4356中,经镜下观察细菌形态学的变化、菌落PCR、质粒PCR、双酶切、SDS-PAGE电泳及Western blot鉴定,证实表达EHEC O157∶H7 Tir-C基因的重组嗜酸乳杆菌菌株构建成功。 四、结论: 1.选取的Tir-C基因抗原表位预测分值较高,大小为675bp。 2.成功构建重组克隆载体pMD19-T-Tir-C和PET-30a(+)-Tir-C原核表达载体。细菌培养物经IPTG诱导表达出重组融合蛋白,纯化得到重组融合蛋白,分子量大小为24KD左右。Western blot初步鉴定该融合蛋白有一定的免疫反应性。 3.表达EHEC O157∶H7 Tir-C基因的重组嗜酸乳杆菌菌株证实构建成功。

著录项

  • 作者

    余芳;

  • 作者单位

    南方医科大学;

  • 授予单位 南方医科大学;
  • 学科 病原生物学
  • 授予学位 硕士
  • 导师姓名 龙北国,范宏英;
  • 年度 2014
  • 页码
  • 总页数
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 中文
  • 中图分类
  • 关键词

    出血型; 大肠埃希菌; 大肠杆菌; 嗜酸乳杆菌;

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