摘要
前言
第一章实验材料
1.1实验用真菌标准株
1.2实验所需的细菌菌株
1.3主要试剂
1.3.1 真菌基因组DNA提取、全血基因组DNA提取
1.3.2细菌基因组DNA提取
1.3.3 PCR扩增,琼脂糖电泳
1.3.4含有目的DNA质粒的构建
1.3.5 ddPCR反应用到的试剂
1.4培养基的配置
1.4.1血培养平板
1.4.2培养基
1.5实验仪器
第二章实验方法
2.1菌株的培养与菌株混悬液的制备
2.1.1标准菌株复苏及储备
2.1.2菌株混悬液的制备
2.2基因组DNA的提取
2.2.1真菌基因组DNA提取
2.2.2细菌基因组DNA提取
2.2.3提取全血DNA(QIAamp(R) UCP Pathogen Mini Kit及Pathogen Lysis Tubes)
2.3引物以及探针的设计及验证
2.4质粒的构建
2.4.1 PCR扩增
2.4.2 2.4.1中的PCR扩增产物进行琼脂糖电泳
2.4.3 PCR产物测序
2.4.5质粒的构建(使用TaKaRa pMDTM 19-T Vector Cloning Kit)
2.4.6质粒鉴定及保存
2.4.7使用TaKaRa Mini BEST Plasmid Purification Kit Ver.4.0 TaKaRa对质粒的目的DNA进行纯化
2.5 ddPCR反应的条件和体系
2.6 ddPCR反应体系优化
2.7灵敏度实验
2.8特异性实验
2.9重复性实验
2.10临床试验
2.11统计学分析
第三章实验结果
3.1引物探针设计
3.2标准菌株培养结果
3.3 PCR产物测序结果
3.4最佳温度的摸索
3.5灵敏度的分析
3.6特异性的验证
3.7重复性的验证
3.8临床样本的结果对比
第四章讨论
第五章结论
参考文献
综述 新生儿侵袭性真菌感染的诊断研究情况
中英文缩略词表
攻读硕士学位期间发表的论文及参与的课题
致谢
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