声明
第一章 前言
1.1 mtDNA概述
1.2 鸟类mtDNA
1.3 噪鹛科鸟类概述
1.4 研究目的与意义
第二章 实验材料和方法
2.1样本采集
2.2 实验方法
2.2.1 mtDNA的提取和检测
2.2.2 PCR扩增与测序
2.3数据处理
2.3.1序列拼接与基因注释
2.3.2 mtDNA的整理
2.4系统发生分析
2.5单基因可靠性分析
第三章 实验结果
3.1橙翅噪鹛mtDNA特征分析
3.1.1 mtDNA结构
3.1.2 mtDNA的碱基特征
3.1.3蛋白编码区分析
3.1.4 rRNA基因
3.1.5 tRNA基因
3.1.6控制区
3.2 灰腹噪鹛mtDNA特征分析
3.2.1 mtDNA结构
3.2.2 mtDNA的碱基特征
3.2.3蛋白编码区分析
3.2.4 rRNA基因
3.2.5 tRNA基因
3.2.6控制区
3.3山噪鹛mtDNA特征分析
3.3.1 mtDNA结构
3.3.2 mtDNA的碱基特征
3.3.3蛋白编码区分析
3.3.4 rRNA基因
3.3.5 tRNA基因
3.3.6控制区
3.4大草鹛mtDNA特征分析
3.4.1 mtDNA结构
3.4.2 mtDNA的碱基特征
3.4.3蛋白编码区分析
3.4.4 rRNA基因
3.4.5 tRNA基因
3.4.6控制区
3.5 16种噪鹛科鸟类的mtDNA分析
3.5.1 16种噪鹛科鸟类的mtDNA特征
3.5.2 16种噪鹛科鸟类的蛋白编码区
3.5.3 16种噪鹛科鸟类的tRNA和rRNA基因。
3.5.4 16种噪鹛科鸟类的控制区
3.6噪鹛科部分鸟类的系统进化
3.6.1进化模型选择
3.6.2基于mtDNA全序列的系统进化树构建
3.6.3基于13个蛋白编码基因串联序列的系统进化树构建
3.6.4基于12个蛋白编码基因串联序列的系统进化树构建
3.6.5基于ND2、ND3和CYTB 3个蛋白编码基因串联序列的系统进化树
3.6.6基于2个D-Loop区序列的系统进化树构建
3.7单基因可靠性分析
第四章 讨论
4.1噪鹛科鸟类的mtDNA特征
4.1.1蛋白编码基因
4.1.2 tRNA和rRNA基因
4.1.3 控制区
4.2系统进化分析
4.3单基因可靠性分析
参考文献
在学期间的研究成果
致谢
